我在c ++中对OOP很陌生,所以请耐心等待。
在我的标题中定义我的成员变量;
class AntibodyJunction
{
private:
//raw seq
seqan::Dna5 _raw_sequence;
//private funcs
void _setVGeneQueryStartTranslation();
public:
//V D and J constructor
AntibodyJunction(AlignAntibody &, AlignAntibody &, AlignAntibody &, seqan::Dna5 &);
~AntibodyJunction() {};
};
和cpp
AntibodyJunction::AntibodyJunction(AlignAntibody & VGene, AlignAntibody &JGene,AlignAntibody & DGene, seqan::Dna5 & raw_sequence)
{
//...some other declaration...//
seqan::Dna5String _raw_sequence = raw_sequence;
std::cout << "constructor parameter\n" << raw_sequence << std::endl;
std::cout << "Template dna5\n" << _raw_sequence << std::endl;
_setVGeneQueryStartTranslation();
};
void AntibodyJunction::_setVGeneQueryStartTranslation(){
std::cout << "other raw seq\n" << _raw_sequence << std::endl;
//...lots of other stuff
}
和输出 - &gt;
constructor parameter
CAGCGATTAGTGGAGTCTGGGGG
Template dna5
CAGCGATTAGTGGAGTCTGGGGG
other raw seq
当我尝试在类函数中访问它时,成员变量_raw_sequence
为空。我知道我可以在构造函数中执行所有操作,但我想了解它为什么要重置。 seqan :: Dna5只是seqan库中用于处理生物数据的dna字符串的模板容器。它拥有dna序列。 Here是文档。这令人困惑,因为我在此功能中访问的其他内容似乎都可用。
答案 0 :(得分:1)
如上所述,您在构造函数中实例化_raw_sequence变量,而不是像这样引用您的成员变量:
this->_raw_sequence = raw_sequence ; //this pointer used to indicate member var
我建议将来通过初始化列表初始化成员变量以避免此类问题。您可以这样重写构造函数:
AntibodyJunction::AntibodyJunction( const AlignAntibody & VGene, const AlignAntibody &JGene, const AlignAntibody & DGene,const seqan::Dna5 & raw_sequence)
: _raw_sequence(raw_sequence)
{
//....
};