scipy.hierarchy:停止聚类超过阈值

时间:2015-03-10 17:46:41

标签: python scipy

我正在尝试使用scipy.hierarchy模块执行群集。我想知道是否有任何方法可以阻止聚类超过阈值。在一个小的测试数组(d=5X5 matrix)上,我使用了一个完整的链接方法来获取链接数组,

fc = hrc.linkage(d , method='complete') 

打印fc给了我以下内容,

0           1.          2.00706122      2.              
2           5.          2.49008944      3.            
3           4.          3.14776579      2.          
6           7.          3.67076599      5.          

我想指定一个阈值(比如2.5),以便在满足该值时停止聚类。例如,在上述情况下,聚类一直持续到最大阈值3.6。

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