Question

如何将.hws文件作为numpy数组加载？
根据{{3}}中的描述，它说它是基于HDF5的格式，所以我发现http://kingler.net/2007/05/22/90可能有用。但是，请按照页面中描述的说明进行操作：

hdf5_file_name = '/reg/d/psdm/XPP/xppcom10/hdf5/xppcom10-r0546.h5'
dataset_name   = '/Configure:0000/Run:0000/CalibCycle:0000/Camera::FrameV1/XppSb4Pim.1:Tm6740.1/image'
event_number   = 5
file    = h5py.File(hdf5_file_name, 'r')  
dataset = file[dataset_name]
arr1ev  = dataset[event_number]
file.close()

在我修复前三行后，我在第六行出错：

file_name = '~/Desktop/audioData_A.hws'
item = h5py.File(file_name, 'r')
print item.name 
ds = item['/']
print len(ds)
arr1ev = ds[1]

返回：

<HDF5 group "/" (1 members)>
1
---------------------------------------------------------------------------
AttributeError                            Traceback (most recent call last)
<ipython-input-59-b33014aeccc8> in <module>()
      4 ds = item['/']
      5 print len(ds)
----> 6 arr1ev = ds[1]

/usr/local/lib/python2.7/site-packages/h5py/_objects.so in     h5py._objects.with_phil.wrapper (/Users/travis/build/MacPython/h5py-wheels/h5py/h5py/_objects.c:2405)()

/usr/local/lib/python2.7/site-packages/h5py/_objects.so in   h5py._objects.with_phil.wrapper (/Users/travis/build/MacPython/h5py-wheels/h5py/h5py/_objects.c:2362)()

/usr/local/lib/python2.7/site-packages/h5py/_hl/group.pyc in __getitem__(self,  name)
    158                 raise ValueError("Invalid HDF5 object reference")
    159         else:
--> 160             oid = h5o.open(self.id, self._e(name), lapl=self._lapl)  
    161 
    162         otype = h5i.get_type(oid) 

/usr/local/lib/python2.7/site-packages/h5py/_hl/base.pyc in _e(self, name, lcpl)
    119         else:
    120             try:
--> 121                 name = name.encode('ascii')
    122                 coding = h5t.CSET_ASCII
    123             except UnicodeEncodeError:

AttributeError: 'int' object has no attribute 'encode'

问题在于我不知道如何获取dataset_name和event_number的信息。根据{{1}}，我的第二行，我猜相应的值应该是item.parent和/，这不起作用。

如果您需要，请在链接中找到该文件： https://confluence.slac.stanford.edu/display/PSDM/How+to+access+HDF5+data+from+Python

Answer 1

我下载了你的文件并查看了它。阅读.hws文件后，您会得到一个只包含一个密钥"wfm_group0"的字典（您可以使用item.keys()查看文件中的密钥）。此键的值再次与字典类似，其中包含键"axes"，"id"，"traces"和"vector"。

不知道你想从那里去哪里，但也许你可以玩这些信息，看看它在哪里。

将基于HDF5的文件作为Python中的numpy数组读取

1 个答案: