将行添加到使用plotrix库创建的图形

时间:2015-02-20 20:58:57

标签: r

我使用multhist库中的plotrix函数创建了堆积直方图,但我无法在此直方图中添加直线。我通常使用的代码似乎不适用于此设置。

这是一个例子。我试图将整个分布的均值和标准误差添加为直方图上的简单垂直线,但这些不能正常工作。我做错了什么?

library(plotrix)

test1<-rnorm(30,0)
test2<-rnorm(30,0)
test3<-rnorm(30,0)

forstats<-c(test1,test2,test3)
mn<-mean(forstats)
se<-std.error(forstats)

together<-list(test1,test2,test3)
multhist(together, col=c(7,4,2), space=c(0,0), beside=FALSE,right=FALSE)

abline(v=mn)
abline(v=mn+se)
abline(v=mn-se)

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

multhist使用barplot,因此,正如@BenBolker提到的here,x轴对应于bin索引。在本机坐标和bin索引单元之间进行转换有点棘手,所以我已经为堆叠直方图(无论如何)放置了另一个函数:

histstack <- function(x, breaks, col=rainbow(length(x)), ...) {
  col <- rev(col)
  if (length(breaks)==1) {
    rng <- range(pretty(range(x)))
    breaks <- seq(rng[1], rng[2], length.out=breaks)
  }
  h <- lapply(x, hist, plot=FALSE, breaks=breaks)
  cumcounts <- apply(sapply(h, '[[', 'counts'), 1, cumsum)

  for(i in seq_along(h)) {
    h[[i]]$counts <- cumcounts[nrow(cumcounts) - i + 1, ]
  }
  max_cnt <- max(sapply(h, '[[', 'counts'))
  plot(h[[1]], xlim=range(sapply(h, '[', 'breaks')), yaxt='n',
       ylim=c(0, max(pretty(max_cnt))), col=col[1], ...)
  sapply(seq_along(h)[-1], function(i) plot(h[[i]], col=col[i], add=TRUE, ...))
  axis(2, at=pretty(c(0, max_cnt)), labels=pretty(c(0, max_cnt)), ...)  
}

这就是:

histstack(together, seq(-3, 3, 0.5), col=c(7, 4, 2), main='', 
          las=1, xlab='', ylab='')

abline(v=c(mn, mn+se, mn-se), lwd=2, )

enter image description here

IMO x轴标记可能比multhist更合适,因为multhist意味着计数与bin-bin值相关,而上面显然x轴标记描绘垃圾箱。