R的ImageJ包

时间:2015-02-05 19:38:39

标签: r image-processing imagej

我正在寻找ImageJ和R的集成。在[1] [2]中有一个名为RImageJ的包用于以前版本的R(我使用的是R 3.1.2(2014-10-31) ) - “南瓜头盔”)但它不再可用。

基本上我想尝试的是在R中的图像上的区域增长算法。有人知道RImageJ的更新版本或允许此算法的其他包吗?

谢谢;)

[1] http://romainfrancois.blog.free.fr/index.php?category/R-package/RImageJ [2] http://cmci.embl.de/documents/101105ij_r_jython#using_imagej_from_r

2 个答案:

答案 0 :(得分:3)

Bio7项目是ImageJ的一个版本,其中包含与R的集成,以及其他改进。

值得一提的是,ImageJ2 project正在开发一个名为scripting-r的项目,该项目旨在提供基于RServe构建的符合JSR-223的脚本语言。但是,它尚未发挥作用。一旦完成,就可以从ImageJ Script Editor中执行R代码作为脚本。

编辑2016-09-26:在撰写本文时,SciJava scripting-r项目现在构建在Renjin上,这是JVM顶层的R实现。好哇!

答案 1 :(得分:0)

我过去曾使用pixmap包进行图像处理,但它非常简单。它也可能值得研究包地貌。