做了很多相关性测试

时间:2015-01-21 16:11:23

标签: r testing correlation

我有这样的15个数字列(值是随机的,而不是我的真实数据):

Val(numeric):      val.2:              Val.3   ....   Val.15  
1.698              1.689               5.478           5.68
4.98               0.65                69.47           4.78
0.123              3                   12 .698         6.98
-----------------------------------------------------------
0.047              65.98               123.47          1.547

我计算了每个变量之间的相关性:

          val      val.2  ...  val.15                  
val       1        0.32         0.1256                  
val.2     0.9      1            0.125    
...
val.15    0.36    0.12          1               

但我想在每列之间进行相关性测试(cor.test())。 有没有办法自动完成,而不是做很多测试,如: cor.test(df $ val,df $ val.2,method ='spearman')
cor.test(df $ val,df $ val.3,method ='spearman')
......等 cor.test(df $ val.14,df $ val.15,method ='spearman')

2 个答案:

答案 0 :(得分:1)

你可以尝试

library(Hmisc)
rcorr(as.matrix(df), type='spearman')$P

答案 1 :(得分:0)

任何时候你想对所有对(或其他组合)做某事,combn函数就是一种方法。它将创建对,并可选择在每对上运行一个函数:

> combn(1:4, 2, FUN=function(x) cor.test(iris[,x[1]], iris[,x[2]])$p.value)
[1] 1.518983e-01 0.000000e+00 0.000000e+00
[4] 4.513314e-08 4.073229e-06 0.000000e+00
> p.adjust(.Last.value)
[1] 1.518983e-01 0.000000e+00 0.000000e+00
[4] 1.353994e-07 8.146457e-06 0.000000e+00