Question

我正在尝试创建一个enterotype情节。我关注http://enterotype.embl.de/enterotypes.html。我的问题如何为s.class中的因素着色。我试过了

points(obs.bet$ls[,xax], obs.bet$ls[,yax], col=rainbow(length(unique(design$BF))),cex=1,pch=16)

但这些因素的颜色不正确。此链接中的另一个问题数据使用了k=3群集，但我想使用k=2，但我收到了错误。找到了回复

谢谢！

Answer 1

我遇到了同样的问题。我终于明白了。由于您的最佳K群集是2，因此您应键入

data.cluster=pam.clustering(data.dist, k=2)

输入BCA图之前

。希望它有用。