我正在处理XML数据集(DrugBank数据库可用here),其中某些字段包含转义的XML字符,如"&"等。
为了使问题更具体,这是一个示例场景:
<drugs>
<drug>
<drugbank-id>DB00001</drugbank-id>
<general-references>
# Askari AT, Lincoff AM: Antithrombotic Drug Therapy in Cardiovascular Disease. 2009 Oct; pp. 440–. ISBN 9781603272346. "Google books":http://books.google.com/books?id=iadLoXoQkWEC&pg=PA440.
</general-references>
.
</drug>
<drug>
...
</drug>
...
</drugs>
由于整个文档很庞大,我解析如下:
VTDGen gen = new VTDGen();
try {
gen.setDoc(Files.readAllBytes(DRUGBANK_XML));
gen.parse(true);
} catch (IOException | ParseException e) {
SystemHelper.exitWithMessage(e, "Unable to process Drugbank XML data. Aborting.");
}
VTDNav nav = gen.getNav();
AutoPilot pilot = new AutoPilot(nav);
pilot.selectXPath("//drugs/drug");
while (pilot.evalXPath() != -1) {
long fragment = nav.getContentFragment();
String drugXML = nav.toString((int) fragment, (int) (fragment >> 32));
System.out.println(drugXML);
finerParse(drugXML); // another method handling a more detailed data analysis
}
当我使用示例xml(从相同数据复制粘贴的片段)测试finerParse
方法时,它运行正常。但是,当从上面的代码调用时,它失败并显示错误消息Errors in Entity: Illegal entity char
。在将输入打印到finerParse
(即drugXML
字符串)后,我注意到原始xml中的字符串&pg=PA440
已更改为&#34;&amp; pg = PA440&#34 ;
为什么会这样?我正在做的就是使用一个非常着名的解析器来解析它。
P.S。我已经找到了一个替代解决方案,我只是将VTDNav作为参数传递给finerParse
,而不是先获取内容字符串并传递该字符串。但我仍然对上述方法出了什么问题感到好奇。
答案 0 :(得分:1)
使用vtdNav.toRawString()代替vtdNav.toString(),问题应该消失......让我知道它是否有效。