这是两个问题的组合(Repeat the re-sampling function for 1000 times ? Using lapply?和How do you sample groups in a data.table with a caveat)。
目标是在data.table中对组进行采样,但是重复此过程“n”次并拉出每个行值的平均值。例如:
#generate the data
DT = data.table(a=c(1,1,1,1:15,1,1), b=sample(1:1000,20))
#sample the data as done in the second linked question
DT[,.SD[sample(.N,min(.N,3))],by = a]
a b
1: 1 288
2: 1 881
3: 1 409
4: 2 937
5: 3 46
6: 4 525
7: 5 887
8: 6 548
9: 7 453
10: 8 948
11: 9 449
12: 10 670
13: 11 566
14: 12 102
15: 13 993
16: 14 243
17: 15 42
现在,我尝试使用第一个链接问题中给出的答案:
x <- replicate(100,{DT[,.SD[sample(.N,min(.N,3))],by = a]})
每次重复都会返回一个列表“x”。我能想到访问重复的唯一方法是:
# repetition 1 col-a values
x[[1]]
# repetition 1 col-b values
x[[2]]
# repetition 2 col-a values
x[[3]]
# repetition 2 col-b values
x[[4]]
因此,为了达到每行的平均值,我必须找到x[[j]]
的平均值,其中j
来自seq(2,200,2)
,其中200
是重复* 2
有更简单的方法吗?我尝试过以这种方式使用此解决方案(https://stats.stackexchange.com/questions/8225/how-to-summarize-data-by-group-in-r):
y <- DT[,.SD[sample(.N,min(.N,3))],by = a]
y[,list(mean=mean(b)),by=a]
a mean
1: 1 550
2: 2 849
3: 3 603
4: 4 77
5: 5 973
6: 6 746
7: 7 919
8: 8 655
9: 9 883
10: 10 823
11: 11 533
12: 12 483
13: 13 53
14: 14 827
15: 15 413
但我还没有能够通过复制过程执行此操作。任何帮助都会很棒!
答案 0 :(得分:1)
这样的东西?
根据您的评论,您希望每个复制的组,因此在此示例中,15 * 100表示。这有两种方法可以做到。
library(data.table)
set.seed(1) # for reproducibility
DT = data.table(a=c(1,1,1,1:15,1,1), b=sample(1:1000,20))
x <- replicate(100,{DT[,.SD[sample(.N,min(.N,3))],by = a]})
indx <- seq(1,length(x),2)
result.1 <- mapply(function(a,b)aggregate(b,list(a),mean)$x,x[indx],x[indx+1])
str(result.1)
# num [1:15, 1:100] 569 201 894 940 657 625 62 204 175 679 ...
result.2 <- sapply(x[indx+1],function(b)aggregate(b,x[1],mean)$x)
identical(result.1,result.2)
# [1] TRUE
两种方法都产生15 X 100平均值的方法,其中组在行中,副本在列中。第二种方法利用了事实a
列对于所有重复都是相同的。