将相同的命令应用于多个子目录中的多个文件

Question

我有一个包含94个子目录的目录，每个子目录包含一个或两个文件*.fastq。我需要对每个文件应用相同的python命令，并生成一个新文件qc_*.fastq。

我知道如何将bash脚本单独应用于每个文件，但我想知道是否有办法编写bash脚本以立即将命令应用于所有文件

Answer 1

使用find：

find . -type f -iname "*.fastq" -exec python script {} \;

.：最顶层的目录

-type f：仅限文件

-iname "*.fastq"：文件名以.fastq结尾（不区分大小写）

-exec python script：您要执行的命令。

Answer 2

您可以尝试find . -name "*.fastq" | xargs your_bash_script.sh，使用find获取所有文件并将脚本应用于每个文件。