在R中，如何找到平均值的标准误差？

Question

是否有任何命令可以在R？

中找到平均值的标准误差

Answer 1

标准误差只是标准偏差除以样本大小的平方根。因此，您可以轻松地创建自己的功能：

> std <- function(x) sd(x)/sqrt(length(x))
> std(c(1,2,3,4))
[1] 0.6454972

Answer 2

使用var可能更有效...因为你实际上在你的代码中sqrt两次，一次获得sd（sd的代码在r中并且通过输入“sd”显示）...

se <- function(x) sqrt(var(x)/length(x))

Answer 3

上面的约翰答案的一个版本删除了讨厌的NA：

stderr <- function(x, na.rm=FALSE) {
  if (na.rm) x <- na.omit(x)
  sqrt(var(x)/length(x))
}

Answer 4

plotrix包有一个内置函数：std.error

Answer 5

包sciplot具有内置函数se（x）

Answer 6

由于我时不时要回到这个问题，并且因为这个问题很旧，所以我发布了一个投票最多的答案的基准。

请注意，对于@Ian和@John的答案，我创建了另一个版本。我没有使用length(x)，而是使用sum(!is.na(x))（以避免NA）。 我使用10 ^ 6的向量，重复了1000次。

library(microbenchmark)

set.seed(123)
myVec <- rnorm(10^6)

IanStd <- function(x) sd(x)/sqrt(length(x))

JohnSe <- function(x) sqrt(var(x)/length(x))

IanStdisNA <- function(x) sd(x)/sqrt(sum(!is.na(x)))

JohnSeisNA <- function(x) sqrt(var(x)/sum(!is.na(x)))

AranStderr <- function(x, na.rm=FALSE) {
  if (na.rm) x <- na.omit(x)
  sqrt(var(x)/length(x))
}

mbm <- microbenchmark(
  "plotrix" = {plotrix::std.error(myVec)},
  "IanStd" = {IanStd(myVec)},
  "JohnSe" = {JohnSe(myVec)},
  "IanStdisNA" = {IanStdisNA(myVec)},
  "JohnSeisNA" = {JohnSeisNA(myVec)},
  "AranStderr" = {AranStderr(myVec)}, 
  times = 1000)

mbm

结果：

Unit: milliseconds
       expr     min       lq      mean   median       uq      max neval cld
    plotrix 10.3033 10.89360 13.869947 11.36050 15.89165 125.8733  1000   c
     IanStd  4.3132  4.41730  4.618690  4.47425  4.63185   8.4388  1000 a  
     JohnSe  4.3324  4.41875  4.640725  4.48330  4.64935   9.4435  1000 a  
 IanStdisNA  8.4976  8.99980 11.278352  9.34315 12.62075 120.8937  1000  b 
 JohnSeisNA  8.5138  8.96600 11.127796  9.35725 12.63630 118.4796  1000  b 
 AranStderr  4.3324  4.41995  4.634949  4.47440  4.62620  14.3511  1000 a  


library(ggplot2)
autoplot(mbm)

Answer 7

更一般地说，对于任何其他参数的标准错误，您可以使用启动包进行引导模拟（或者自己编写）

Answer 8

您可以使用pastec包中的stat.desc函数。

library(pastec)
stat.desc(x, BASIC =TRUE, NORMAL =TRUE)

您可以在这里找到更多有关它的信息： https://www.rdocumentation.org/packages/pastecs/versions/1.3.21/topics/stat.desc

Answer 9

请记住，均值也可以通过使用线性模型获得，将变量回归单个截距，还可以使用lm(x~1)函数！

优点是：

• 您立即获得confint()的置信区间
• 您可以使用关于平均值的各种假设的检验，例如使用car::linear.hypothesis()
• 如果您有一些异方差，聚类数据，空间数据等信息，则可以使用更复杂的标准偏差估算，请参见软件包sandwich

## generate data
x <- rnorm(1000)

## estimate reg
reg <- lm(x~1)
coef(summary(reg))[,"Std. Error"]
#> [1] 0.03237811

## conpare with simple formula
all.equal(sd(x)/sqrt(length(x)),
          coef(summary(reg))[,"Std. Error"])
#> [1] TRUE

## extract confidence interval
confint(reg)
#>                   2.5 %    97.5 %
#> (Intercept) -0.06457031 0.0625035

^{由reprex package（v0.3.0）于2020-10-06创建}

Answer 10

y <- mean(x, na.rm=TRUE)

sd(y)表示方差的标准差var(y)。

这两个派生在分母中使用n-1，因此它们基于样本数据。