我正在使用SciPy's boxcox function对连续变量执行Box-Cox transformation。
from scipy.stats import boxcox
import numpy as np
y = np.random.random(100)
y_box, lambda_ = ss.boxcox(y + 1) # Add 1 to be able to transform 0 values
然后,我拟合一个统计模型来预测这个Box-Cox变换变量的值。模型预测采用Box-Cox量表,我想将它们转换为变量的原始比例。
from sklearn.ensemble import RandomForestRegressor
rf = RandomForestRegressor()
X = np.random.random((100, 100))
rf.fit(X, y_box)
pred_box = rf.predict(X)
但是,在找到转换后的数据和lambda时,我找不到执行反向Box-Cox变换的SciPy函数。有这样的功能吗?我现在编码了一个逆变换。
pred_y = np.power((y_box * lambda_) + 1, 1 / lambda_) - 1
答案 0 :(得分:12)
请遵循以下代码:
#Function
def invboxcox(y,ld):
if ld == 0:
return(np.exp(y))
else:
return(np.exp(np.log(ld*y+1)/ld))
# Test the code
x=[100]
ld = 0
y = stats.boxcox(x,ld)
print invboxcox(y[0],ld)
答案 1 :(得分:7)
SciPy添加了逆Box-Cox转换。
https://docs.scipy.org/doc/scipy/reference/generated/scipy.special.inv_boxcox.html
scipy.special.inv_boxcox scipy.special.inv_boxcox(y,lmbda)=
计算Box-Cox变换的倒数。
找到x:
y = (x**lmbda - 1) / lmbda if lmbda != 0
log(x) if lmbda == 0
参数: y:array_like
要转换的数据。
lmbda:array_like
Box-Cox变换的功率参数。
返回:
x:数组
转化数据。
注释
0.16.0版中的新功能。
示例:
from scipy.special import boxcox, inv_boxcox
y = boxcox([1, 4, 10], 2.5)
inv_boxcox(y, 2.5)
output: array([1., 4., 10.])
答案 2 :(得分:4)
感谢@Warren Weckesser,我了解到目前SciPy的实现没有扭转Box-Cox转换的功能。但是,未来的SciPy版本可能具有此功能。目前,我在我的问题中提供的代码可能会为其他人提供反转Box-Cox转换的代码。
答案 3 :(得分:0)
为了使用scipy.special.inv_boxcox从scipy.stats.boxcox反转boxcox转换,您必须识别生成的lambda。
首先应用转换并打印lambda(即参数)。
df[feature_boxcox], param = stats.boxcox(df[feature])
print('Optimal lambda', param)
然后,为了反转变换,请输入生成的lambda。
inv_boxcox(df[feature_boxcox], param)
答案 4 :(得分:0)
我建议看一下 Yeo-Johnson 变换,它是 Box-Cox 模拟,但可以处理负值,并且是一个很好的 implemented in scikit-learn 库,可以轻松进行逆变换。
我将它与 fbprophet 库一起使用(预测):
from sklearn.preprocessing import PowerTransformer
from fbprophet import Prophet
from fbprophet.plot import plot_cross_validation_metric
from fbprophet.diagnostics import cross_validation
from fbprophet.diagnostics import performance_metrics
import numpy as np
import pandas as pd
def inverse_transform(df, pt_instance, features):
for feature in features:
df[feature] = pt_instance.inverse_transform(np.array(df[feature]).reshape(-1,1))
return df
pt = PowerTransformer(method='yeo-johnson')
train_df_transformed = train_df.copy()
train_df_transformed['y'] = pt.fit_transform(np.array(train_df['y']).reshape(-1,1))
model = Prophet(**hyperparams)
model.fit(train_df_transformed)
df_cv = cross_validation(model, initial='14 days', period='3 days', horizon='1 day', parallel="processes")
df_cv = inverse_transform(df_cv, pt, ['yhat','yhat_lower','yhat_upper'])
df_cv = pd.merge(df_cv.drop(columns=['y']),train_df, left_on='ds', right_on='ds')
df_p = performance_metrics(df_cv, metrics=['mae','mape'], rolling_window=1)
fig1 = plot_cross_validation_metric(df_cv, metric='mape')
fig2 = plot_cross_validation_metric(df_cv, metric='mae')