我参加了生物信息学课程,并且我继续在ReverseComp.txt第4行调用了#34;未定义的子程序& main :: Print。"错误
# ReverseComp.txt => takes DNA sequence from user
# and returns the reverse complement
print ("please input DNA sequence:\n");
$DNA =<STDIN>;
$DNA =~tr/ATGC/TACG/; # Find complement of DNA sequence
$DNA =~reverse ($DNA); # Reverse DNA sequence
print ("Reverse complement of sequence is:\n");
print $DNA."\n";
这是我的代码,我在第4行尝试了一些不同的东西但没有结果。有什么建议? (我是在提示中写的,一切看起来都正确......)
答案 0 :(得分:7)
我有一些与您的代码相关的注释:
使用.pl
扩展名而不是.txt
为您的脚本命名。这是Perl脚本的公认接受扩展(以及Perl模块的.pm
,具有可重用代码的库)
始终使用use strict; use warnings;
启动脚本。这些句子可以帮助您避免常见错误。
在使用之前声明您的变量(请参阅my function)
chomp
来自STDIN
的输入,以删除最后的换行符。
对反向函数的调用是奇数。我认为$DNA =~ reverse ($DNA);
应为$DNA = reverse ($DNA);
reverse function更常用于Perl数组;使用字符串,您可以获得该字符串的反转版本,就像我预期的那样。
print function可能会列出参数列表,因此您可以用一个句子打印多个内容
您可以在许多地方省略括号,例如reverse($a)
与reverse $a
相同。两者都有效,但后者更适合Perl编写代码的风格。建议阅读Perl style guide
与您的问题相关,我认为您的脚本是正确的,因为打印函数存在于Perl中,并且您得到的错误与Print相关(使用大写,这在Perl中很重要)。您可以运行您在此处发布的其他脚本。
这是您应用先前注意事项的脚本(ReverseComp.pl
):
use strict;
use warnings;
print "please input DNA sequence:\n";
chomp( my $DNA = <STDIN> );
$DNA =~ tr/ATGC/TACG/; # Find complement of DNA sequence
$DNA = reverse $DNA; # Reverse DNA sequence
print "Reverse complement of sequence is:\n", $DNA, "\n";
无论如何,欢迎来到梦幻般的Perl世界,并准备好享受您的旅行。