R计算数据框中的实例

Question

我试图在这里避免使用for循环。我有一个看起来像这样的数据框

sample1,[species 1],[species 2],[species 1]
sample2,[species 3],[species 2],[species 4]
sample3,[species 6],[species 5]
sample3,[species 6],[species 5],[species 7],[species 5]
etc.

每个样本中的列数不相等。我想要计算物种总数。但是，如果物种在不同的样本中，物种只会被视为单独的。例如，物种1仅出现1次，而不是2次。物种5应该出现2次，而不是3次。

以下是我目前拥有1列的代码：

counts <- data.frame(table(str_extract(tolower(df[,column]), "\\[(.*?)\\]")))

希望这是有道理的。如果有任何混淆，我可以编辑问题。 谢谢！