所以我有一个csv数据集,我的书很好,并且我试图让pandas
包正确加载它。标题由5个列名组成,但最后一列由包含未转义逗号的JSON对象组成。 e.g。
A,B,C,D,E
1,2,3,4,{K1:V1,K2:V2}
我使用简单的training = pd.read_csv('data/training.dat')
然而,大熊猫显然将其他逗号误解为新的未标记列,并且我收到如下错误:
CParserError: Error tokenizing data. C error: Expected 75 fields in line 3, saw 84
我试图导航文档,但显然失败了,是否有人知道如何正确配置pd.read_csv
命令以正确解析它?
我想另一种选择是我可以将一个密钥联合作为列来整合JSON对象的脚本。
答案 0 :(得分:3)
如果您可以将{
替换为"{
,将}
替换为}"
,则可以通过以下方式正确读取:pd.read_csv('data/training.dat',quotechar='"',skipinitialspace=True)
或者选择基于正则表达式的解决方案:
In [205]:
print pd.read_csv('a.data',sep=",(?![^{]*\})", header=None)
0 1 2 3 4
0 A B C D E
1 1 2 3 4 {K1:V1,K2:V2}
[2 rows x 5 columns]
答案 1 :(得分:2)
我认为这取决于您尝试使用JSON做什么。如果您只是想忽略它,可能最简单的方法是将评论字符设置为{
(对于此和下一个,我假设您在其他列中没有任何大括号。)
pd.read_csv(
'woo.csv',
comment='{'
)
可以使用read_csv
的自定义分隔符从JSON中提取元素,尽管我完全不相信这是一种明智的方法。如果它是一个捕获组(它在内部使用re.split
),Pandas会将分隔符变成一列,所以我可以得到一个包含JSON的列。不幸的是,由于这个原因我也得到了一大堆空列;因此dropna
。
我通过loads
和dumps
发送了JSON,但显然你想要做一些更明智的事情。 :)
json_bit = lambda x: json.dumps(json.loads(x))
pd.read_csv(
'woo.csv',
sep=r'(\{.*\})$|,',
converters={'None.3': json_bit}
).dropna(axis=1)
示例CSV
A,B,C,D,E
1,2,3,4,{"K1":"V1","K2":"V2"}
3,2,3,4,{"K1": "V1", "k£": {"k3": "v3"}, "K2":"V2"}
答案 2 :(得分:0)
无需预处理csv文件,只需使用引擎类型python:
dataset = pd.read_csv('sample.csv', sep=',', engine='python')