我认为这是一个非常微不足道的问题,但是,我正在寻找能够显示slurm作业ID所使用的CPU时间和内存的(我猜的猜测)命令。
答案 0 :(得分:38)
你是对的,因为sacct命令是你正在寻找的。 --format开关是另一个关键元素。如果您运行此命令:
sacct -e
您将获得可用于 - 格式开关的不同字段的打印输出。每个字段的详细信息在手册页的“作业帐户字段”部分中进行了描述。对于CPU时间和内存,CPUTime和MaxRSS可能是您正在寻找的。如果您想要以秒为单位的数字,也可以使用cputimeraw,而不是通常的Slurm时间格式。
sacct --format="CPUTime,MaxRSS"
答案 1 :(得分:14)
sacct
确实是用于完成工作的命令。对于正在运行的作业,您可以查看sstat
命令。
答案 2 :(得分:6)
@ aaron.kizmiller是对的,sacct
是要使用的命令。
可以通过将所有以下字段传递到saact --format="field,field"
<强> Fields 强>:
Account AdminComment AllocCPUS AllocGRES
AllocNodes AllocTRES AssocID AveCPU
AveCPUFreq AveDiskRead AveDiskWrite AvePages
AveRSS AveVMSize BlockID Cluster
Comment ConsumedEnergy ConsumedEnergyRaw CPUTime
CPUTimeRAW DerivedExitCode Elapsed ElapsedRaw
Eligible End ExitCode GID
Group JobID JobIDRaw JobName
Layout MaxDiskRead MaxDiskReadNode MaxDiskReadTask
MaxDiskWrite MaxDiskWriteNode MaxDiskWriteTask MaxPages
MaxPagesNode MaxPagesTask MaxRSS MaxRSSNode
MaxRSSTask MaxVMSize MaxVMSizeNode MaxVMSizeTask
McsLabel MinCPU MinCPUNode MinCPUTask
NCPUS NNodes NodeList NTasks
Priority Partition QOS QOSRAW
ReqCPUFreq ReqCPUFreqMin ReqCPUFreqMax ReqCPUFreqGov
ReqCPUS ReqGRES ReqMem ReqNodes
ReqTRES Reservation ReservationId Reserved
ResvCPU ResvCPURAW Start State
Submit Suspended SystemCPU Timelimit
TotalCPU UID User UserCPU
WCKey WCKeyID WorkDir
例如,要列出所有作业ID,已用时间和最大VM大小,您可以运行:
sacct --format='JobID,Elapsed,MaxVMSize'
答案 3 :(得分:2)
尽管已经存在出色的解决方案,但我有另一个看法。
该方法可以对很多节点进行实时监控。
我们可以编写脚本monitor.sh
来获取统计信息(以内存为例),然后将其记录到文件中。
#! /bin/sh
if [ -f "./free.log_"`hostname` ];then
echo "file existed , now deleting it !"
rm ./free.log_`hostname`
fi
echo "start recording!"
while true
do
echo "******["`date +%Y-%m-%d_%H:%M:%S`"]******" >> free.log_`hostname`
free -s 1 -c 2 -h|sed -n 1,2p >> free.log_`hostname`
done
然后编写作业脚本sbatch_input.sh
,可以通过sbatch调用。
#! /bin/sh
#SBATCH -N 2
#SBATCH -p cnall
srun hostname
srun ./monitor.sh
调用脚本
sbatch ./sbatch_input.sh
我们可以看到一些日志生成。
答案 4 :(得分:0)
其他人回答sacct
输出的所有详细信息格式,这对于查看表中聚合的多个作业非常有用。
但是,有时您希望更详细地查看特定作业,因此可以判断您的作业是否有效地使用了分配的资源。为此,seff
非常有用。语法就是seff <Jobid>
。例如,这是我最近的一项工作(失败了):
$ seff 15780625
Job ID: 15780625
Cluster: mycluster
User/Group: myuser/mygroup
State: OUT_OF_MEMORY (exit code 0)
Nodes: 1
Cores per node: 16
CPU Utilized: 12:06:01
CPU Efficiency: 85.35% of 14:10:40 core-walltime
Job Wall-clock time: 00:53:10
Memory Utilized: 1.41 GB
Memory Efficiency: 70.47% of 2.00 GB
请注意,关键的CPU指标“ CPU使用率”对应于sacct
中的 TotalCPU 字段,而“内存使用率”对应于 MaxRSS 。