Question

我在大型国家系统上访问了低优先级队列。我当时只能在队列中分配1个工作。

PBS作业包含一个在壁垒结束前不太可能完成的程序。保留的作业不能以超过3的数字排队。

这意味着：

我无法使用-W depend=afterok:$ID_of_previous_job。该脚本将立即提交所有作业，但只有前3个将进入队列（H状态中的最后2个）
我无法使用提交next_job的最后一行修改提交脚本（实际程序很可能在walltime结束之前完成，然后是最后一行没有执行。
我无法安装任何软件，所以我只能使用Bash脚本而不是Torque
我宁愿不使用＆＃34;时间检查＆＃34;脚本（例如：每隔5分钟检查previous_job是否结束）

是否可以使用while和/ sleep？

Answer 1

选项1 要使用while和sleep，您需要执行与时间检查脚本非常相似的操作：

#!/bin/bash
jobid=`submit the first job`
while [[ -z `qstat ${jobid} | grep C` ]]; do
  sleep 5
done

# submit the new job once the loop is done, after checking the exit status if desired

选项2 - 可能只是TORQUE，不确定： Dmitri Chubarov在评论中提出的更好的方法可能是使用每个工作的结局选项。要做到这一点，计算节点必须能够提交作业，但由于你正在考虑完成工作的最后一行，所以这似乎是一种可能性。

通过在脚本中添加以下行来向作业添加一个perjob结局： #PBS -l epilogue = / path / to / script

然后有脚本：

#!/bin/bash
# check exit code if desired, its argument 10 to the script
# submit the next job

在没有Torque的情况下持有PBS状态的bash脚本

这意味着：

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