gcc编译器无法安装R包，安装lpSolve

Question

我得到了一个＆＃34; -Werror = format-security＆＃34; gcc在R中编译lpSolve时出错。

我正在使用Ubuntu 12.04（lubuntu内核）和R版本3.1.0。

这是确切的错误：

   * installing *source* package ‘lpSolve’ ...
** libs
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I . -DINTEGERTIME -DPARSER_LP -DBUILDING_FOR_R -DYY_NEVER_INTERACTIVE -DUSRDLL -DCLOCKTIME -DRoleIsExternalInvEngine -DINVERSE_ACTIVE=INVERSE_LUSOL -DINLINE=static -DParanoia     -fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Wformat-security -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c colamd.c -o colamd.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I . -DINTEGERTIME -DPARSER_LP -DBUILDING_FOR_R -DYY_NEVER_INTERACTIVE -DUSRDLL -DCLOCKTIME -DRoleIsExternalInvEngine -DINVERSE_ACTIVE=INVERSE_LUSOL -DINLINE=static -DParanoia     -fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Wformat-security -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c commonlib.c -o commonlib.o
commonlib.c: In function ‘blockWriteINT’:
commonlib.c:691:3: error: format not a string literal and no format arguments [-Werror=format-security]
commonlib.c: In function ‘blockWriteBOOL’:
commonlib.c:710:3: error: format not a string literal and no format arguments [-Werror=format-security]
commonlib.c: In function ‘blockWriteREAL’:
commonlib.c:732:3: error: format not a string literal and no format arguments [-Werror=format-security]
cc1: some warnings being treated as errors
make: *** [commonlib.o] Error 1
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I . -DINTEGERTIME -DPARSER_LP -DBUILDING_FOR_R -DYY_NEVER_INTERACTIVE -DUSRDLL -DCLOCKTIME -DRoleIsExternalInvEngine -DINVERSE_ACTIVE=INVERSE_LUSOL -DINLINE=static -DParanoia     -fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Wformat-security -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c commonlib.c -o commonlib.o
commonlib.c: In function ‘blockWriteINT’:
commonlib.c:691:3: error: format not a string literal and no format arguments [-Werror=format-security]
commonlib.c: In function ‘blockWriteBOOL’:
commonlib.c:710:3: error: format not a string literal and no format arguments [-Werror=format-security]
commonlib.c: In function ‘blockWriteREAL’:
commonlib.c:732:3: error: format not a string literal and no format arguments [-Werror=format-security]
cc1: some warnings being treated as errors
make: *** [commonlib.o] Error 1
ERROR: compilation failed for package ‘lpSolve’
* removing ‘/home/ben/lpSolve.Rcheck/lpSolve’

我尝试使用R CMD INSTALL手动安装它。我也按照here的说明无效。

谢谢你的期待。

Answer 1

错误发生在函数的fprintf中，因此如果你下载源代码，重新制作包，它就会被解决。但lpSolve包装目前是孤立的。由于编译器检查可能会发生错误。这是一种绕道而行的方法。

1. 转到R etc路径（例如/ usr / lib / R / etc或/ etc / R）。
2. 编辑Makeconf文件：删除CFLAGS中的-Werror = format-security。 （它是只读文件，因此需要su权限。）
3. 重新安装软件包：install.package（'lpSolve'）
4. 如有必要，请恢复Makeconf文件。

我希望这对你有所帮助。