找到椭圆的主轴

Question

我有一个包含椭圆（单元格）的图像，我正在尝试计算其主轴和短轴。我知道我必须首先计算出主轴，可能还要考虑到之前的焦点，但我不确定如何准确地解决这个问题。

我不知道如何在图像中循环以获得测量结果，以及如果我这样做，如何正确识别主轴。

如果有人能提供有关如何进行此操作的任何信息，那将是一个很大的帮助。

Answer 1

识别细胞通常很难。我不认为在不了解图像外观的更多细节的情况下，我可以给出任何好的建议。

如果单元格几乎是圆形的一种可能性，那就是从实际找到最合适的圆开始，这些圆作为imfindcirles内置在图像处理工具箱中。然后你可以找到边缘，在各个方向上投射光线，直到它们碰到那些边缘，并相应地选择一个主轴和一个短轴。

计算机视觉系统分析工具箱具有explicit blob detection algorithms，可以开箱即用。特别是它会告诉你主轴和副轴。

Answer 2

如果您的图像不包含“噪音”，那么您可能想要做的只是使用来自细胞边界的信息。具体来说，您需要得到单元格“边缘”的（x，y）点对。然后你可以运行PCA来获得2个主导方向。

你可能会在Matlab中做到这一点，对吗？ （或者你需要自动化，所以用C ++或python编写？）。如果是这样，您需要模糊单元格的内部，因为它不包含任何有用的信息。然后，找到形状的边缘。这两个都是形态学操作，非常好地解释in this example 和this one。然后你可以使用matlab的PCA（或svd）函数。

如果您需要更多指导，请告诉我们！