Question

我想在R中应用一个循环来处理几个文件，每次一个文件。文件具有完全相同的模式，只是字符串＆＃34; ... split1 ...＆＃34;是我的文件的新月号。然后有一个文件，如＆＃34; ... split1 ...＆＃34;，＆＃34; ... split2 ...＆＃34; ......＆＃34; ... split777 ......＆＃34;。我想要输出文件，例如在相同的逻辑中，例如：＆＃34; newsplit1.txt＆＃34;，＆＃34; newsplit2.txt＆＃34; ...＆＃34; newsplit777.txt＆＃34;。

all <- read.table("nsamplescluster.split1.adjusted", header=TRUE, sep=";") all <- all[, -grep("GType", colnames(all))] write.table(all, "newsplit1.txt", sep=";")

干杯！

Answer 1

使用循环和粘贴文件名。

for(i in 1:777){
    infile <- paste0("nsamplescluster.split",i,".adjusted")
    outfile <- paste0("newsplit",i,".txt")
    all <- read.table(infile, header=TRUE, sep=";")
    all <- all[, -grep("GType", colnames(all))]
    write.table(all, outfile, sep=";")
}

Answer 2

如果文件都在同一目录中，您也可以使用

 filenames<- list.files(your.directory, pattern="nsamplescluster")

这将创建一个载体，其中所有文件名都在your.directory中，并带有指示的图案。然后，您可以使用它来循环文件。例如，

 for(i in filenames){
 do stuff
 }

如果文件数量发生变化，这可能会派上用场。

将任务应用于R中的多个文件

2 个答案: