python中正则表达式中的重复次数

Question

说我有以下正则表达式：

"GGAGG.{5,13}?(ATG|GTG|TTG)(...)+?(TGA|TAA|TAG)"

有没有办法看到该部件正在进行多少次重复。{5,13}？ 想知道GGAGG和起始密码子之间有多远。我可以稍后手动搜索它，但想知道原始正则表达式中是否有更好的方法。

Answer 1

你可以做到

"GGAGG(.{5,13}?)(ATG|GTG|TTG)(...)+?(TGA|TAA|TAG)"

然后使用像

这样的代码

rem = re.match(pat, s)
dist_between_ggagg_and_start_codon = len(rem.group(1))

Answer 2

您可以使用match.start方法获取整个比赛或组的位置。使用该信息：

>>> import re
>>> seq = 'xxxxGGAGGxxxxxxxATGxxxTGA'
>>> pattern = "GGAGG.{5,13}?(ATG|GTG|TTG)(...)+?(TGA|TAA|TAG)"
>>> match = re.search(pattern, seq)
>>> match.start(1) - match.start() - 5 # 5 = len(GGAGG)
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