Question

我想用斐济创建一个宏，然后我将使用matlab运行。

我想使用Plugins>Stacks>Average Images平均3张图片。

我首先使用插件＆gt;宏＆gt;记录... 来了解要使用的内容。结果如下：

run("Average Images", "add=D:\\Corinne\\diabetes_paper_meas\\2013_01_29\\Measurement.007_cb\\Measurement._cb_frame0_pvar-8bit_combined.tif add=D:\\Corinne\\diabetes_paper_meas\\2013_01_29\\Measurement.007_cb\\Measurement._cb_frame1_pvar-8bit_combined.tif add=D:\\Corinne\\diabetes_paper_meas\\2013_01_29\\Measurement.007_cb\\Measurement._cb_frame2_pvar-8bit_combined.tif");
saveAs("Tiff", "D:\\Corinne\\diabetes_paper_meas\\2013_01_29\\Measurement.007_cb\\test.tif");

然而，即使我运行此宏我也收到错误：没有选择图像文件。但是，在斐济，您不需要打开任何图像来运行插件，但是您可以通过窗口界面添加文件... 所以当然，因为只运行宏不起作用我在使用下面的宏时会得到相同的错误：

file = getArgument;
if (file=="") exit ("No argument!");
setBatchMode(true);
file_vasc = file;

file_vasc_frame_0 = file;
file_vasc_frame_1 = replace(file, "\\_frame0_pvar-8bit_combined.tif", "_frame1_pvar-8bit_combined.tif");
file_vasc_frame_2 = replace(file, "\\_frame0_pvar-8bit_combined.tif", "_frame2_pvar-8bit_combined.tif");


run("Average Images", "add=file_vasc_frame_0 add=file_vasc_frame_1 add=file_vasc_frame_2");
file_vasc_out = replace(file, "frame0_pvar-8bit_combined.tif", "_vasc_averaged.tif");
saveAs("Tiff", file_vasc_out);

有人知道我该怎么办？

由于

Answer 1

Average Images 插件以非标准方式使用对话框，因此无法编写脚本：在斐济运行插件时，宏录制器处于活动状态（插件＆gt;宏＆gt;记录。 .. 然后插件＆gt;堆栈＆gt;平均图像），只要您将第二个文件添加到列表中，您就会看到斐济抱怨：

重复关键字：


命令：“平均图像”

关键字：“添加”

值：/ path / to / your / file


在对话框中的相应标签上添加下划线，使第一个单词成为唯一。

这显然是插件中的一个错误（它会多次使用相同的OpenDialog，从而在宏录制器中记录重复的关键字）。您可以通过帮助＆gt;报告错误进行报告，但我担心此插件目前尚未得到主动维护。

在任何情况下，使用图像＆gt;堆栈＆gt;图像堆栈和图像＆gt;堆栈＆gt; Z项目，有一种简单的替代方法来平衡ImageJ中的图像而不需要此插件。 .. 命令：

setBatchMode(true);
open("/path/to/first-image.tif");
open("/path/to/second-image.tif");
run("Images to Stack", "name=stack title=[]");
run("Z Project...");
saveAs("Tiff", "/path/to/new-file-name.tif");

使用调用插件“平均图像”的宏时，斐济错误：“未选择图像文件”

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