在numpy中,计算一个矩阵,其中每个单元格包含该行中所有其他条目的乘积

时间:2014-03-16 09:28:06

标签: python math numpy matrix

我有一个矩阵

A = np.array([[0.2, 0.4, 0.6],
              [0.5, 0.5, 0.5],
              [0.6, 0.4, 0.2]])

我想要一个新的矩阵,其中第i行和第j列中的条目的值是第i行的所有条目的乘积,除了第j列中该行的单元格。

array([[ 0.24,  0.12,  0.08],
       [ 0.25,  0.25,  0.25],
       [ 0.08,  0.12,  0.24]])

我首先遇到的解决方案是

np.repeat(np.prod(A, 1, keepdims = True), 3, axis = 1) / A

但只有当条目的值为零时,这才有效。

有什么想法?谢谢!

编辑:我已经开发了

B = np.zeros((3, 3))
for i in range(3):
    for j in range(3):
        B[i, j] = np.prod(i, A[[x for x in range(3) if x != j]])

但肯定有更优雅的方法来实现这一点,它使用numpy的高效C后端而不是低效的python循环?

5 个答案:

答案 0 :(得分:4)

如果你愿意忍受一个循环:

B = np.empty_like(A)
for col in range(A.shape[1]):
    B[:,col] = np.prod(np.delete(A, col, 1), 1)

计算你需要的东西,一次一列。它没有理论上那么有效,因为np.delete()创建了一个副本;如果您非常关心内存分配,请改用掩码:

B = np.empty_like(A)
mask = np.ones(A.shape[1], dtype=bool)
for col in range(A.shape[1]):
    mask[col] = False
    B[:,col] = np.prod(A[:,mask], 1)
    mask[col] = True

答案 1 :(得分:3)

使用repeat对您的解决方案进行修改,使用[:,None]

np.prod(A,axis=1)[:,None]/A

我对处理0s的第一次尝试是:

In [21]: B
array([[ 0.2,  0.4,  0.6],
       [ 0. ,  0.5,  0.5],
       [ 0.6,  0.4,  0.2]])

In [22]: np.prod(B,axis=1)[:,None]/(B+np.where(B==0,1,0))
array([[ 0.24,  0.12,  0.08],
       [ 0.  ,  0.  ,  0.  ],
       [ 0.08,  0.12,  0.24]])

但正如评论指出的那样; [0,1]单元格应为0.25。

这可以解决这个问题,但是当连续存在多个0时会出现问题。

In [30]: I=B==0
In [31]: B1=B+np.where(I,1,0)
In [32]: B2=np.prod(B1,axis=1)[:,None]/B1
In [33]: B3=np.prod(B,axis=1)[:,None]/B1
In [34]: np.where(I,B2,B3)
Out[34]: 
array([[ 0.24,  0.12,  0.08],
       [ 0.25,  0.  ,  0.  ],
       [ 0.08,  0.12,  0.24]])

In [55]: C
array([[ 0.2,  0.4,  0.6],
       [ 0. ,  0.5,  0. ],
       [ 0.6,  0.4,  0.2]])
In [64]: np.where(I,sum1[:,None],sum[:,None])/C1
array([[ 0.24,  0.12,  0.08],
       [ 0.5 ,  0.  ,  0.5 ],
       [ 0.08,  0.12,  0.24]])

Blaz Bratanic的epsilon方法是最好的非迭代解决方案(到目前为止):

In [74]: np.prod(C+eps,axis=1)[:,None]/(C+eps)

迭代列的不同解决方案:

def paulj(A):
    P = np.ones_like(A)
    for i in range(1,A.shape[1]):
        P *= np.roll(A, i, axis=1)
    return P

In [130]: paulj(A)
array([[ 0.24,  0.12,  0.08],
       [ 0.25,  0.25,  0.25],
       [ 0.08,  0.12,  0.24]])
In [131]: paulj(B)
array([[ 0.24,  0.12,  0.08],
       [ 0.25,  0.  ,  0.  ],
       [ 0.08,  0.12,  0.24]])
In [132]: paulj(C)
array([[ 0.24,  0.12,  0.08],
       [ 0.  ,  0.  ,  0.  ],
       [ 0.08,  0.12,  0.24]])

我在大矩阵上尝试了一些时间

In [13]: A=np.random.randint(0,100,(1000,1000))*0.01

In [14]: timeit paulj(A)
1 loops, best of 3: 23.2 s per loop

In [15]: timeit blaz(A)
10 loops, best of 3: 80.7 ms per loop

In [16]: timeit zwinck1(A)
1 loops, best of 3: 15.3 s per loop

In [17]: timeit zwinck2(A)
1 loops, best of 3: 65.3 s per loop

epsilon近似可能是我们可以预期的最佳速度,但有一些舍入问题。必须迭代许多列会损害速度。我不确定为什么np.prod(A[:,mask], 1)方法最慢。

eeclo https://stackoverflow.com/a/22441825/901925建议使用as_strided。以下是我认为他的想法(改编自重叠的块问题,https://stackoverflow.com/a/8070716/901925

def strided(A):
    h,w = A.shape
    A2 = np.hstack([A,A])
    x,y = A2.strides
    strides = (y,x,y)
    shape = (w, h, w-1)
    blocks = np.lib.stride_tricks.as_strided(A2[:,1:], shape=shape, strides=strides)
    P = blocks.prod(2).T # faster to prod on last dim
    # alt: shape = (w-1, h, w), and P=blocks.prod(0)
    return P

(1000,1000)数组的时间相对于列迭代而言是相当大的改进,但仍然比epsilon方法慢得多。

In [153]: timeit strided(A)
1 loops, best of 3: 2.51 s per loop

另一种索引方法虽然相对简单,但速度较慢,并且会更快地产生内存错误。

def foo(A):
    h,w = A.shape
    I = (np.arange(w)[:,None]+np.arange(1,w))
    I1 = np.array(I)%w
    P = A[:,I1].prod(2)
    return P

答案 2 :(得分:3)

我在奔跑,所以我没有时间研究这个解决方案;但是id做的是在最后一个轴上创建一个连续的圆形视图,通过沿着最后一个轴将数组连接到自身,然后使用np.lib.index_tricks.as_strided选择合适的元素来获取np.prod 。没有python循环,没有数值近似。

编辑:你走了:

import numpy as np

A = np.array([[0.2, 0.4, 0.6],
              [0.5, 0.5, 0.5],
              [0.5, 0.0, 0.5],
              [0.6, 0.4, 0.2]])

B = np.concatenate((A,A),axis=1)
C = np.lib.index_tricks.as_strided(
        B,
        A.shape  +A.shape[1:],
        B.strides+B.strides[1:])
D = np.prod(C[...,1:], axis=-1)

print D

注意:这种方法并不理想,因为它是O(n ^ 3)。请参阅我的其他发布解决方案,即O(n ^ 2)

答案 3 :(得分:2)

如果您愿意容忍小错误,可以使用您最初提出的解决方案。

A += 1e-10
np.around(np.repeat(np.prod(A, 1, keepdims = True), 3, axis = 1) / A, 9)

答案 4 :(得分:1)

这是一个没有python循环或数值近似的O(n ^ 2)方法:

def double_cumprod(A):
    B = np.empty((A.shape[0],A.shape[1]+1),A.dtype)
    B[:,0] = 1
    B[:,1:] = A
    L = np.cumprod(B, axis=1)
    B[:,1:] = A[:,::-1]
    R = np.cumprod(B, axis=1)[:,::-1]
    return L[:,:-1] * R[:,1:]

注意:它似乎是数值近似方法的两倍慢,这符合预期。