R data.table条件查找/替换

Question

我有一个data.table（sbd_sbmolbio_n）。我需要找到两个条件成立的行：

ORF_SEQUENCE包含“MKTIIALSYIFCLVFA”

N_TAG包含“Signal Seq”

然后我需要用“HA”替换N_TAG的“Signal Seq”部分，但保留字符串的其余部分（例如“Signal Seq-10XHis-Tev”变为“HA-10XHis-Tev”

我正在尝试这个：

sbd_sbmolbio_n[grep("MKTIIALSYIFCLVFA",ORF_SEQUENCE),][grep("Signal Seq", N_TAG), N_TAG := sub("Signal Seq", "HA", N_TAG)]

找到了行，但没有进行替换。有什么想法吗？

Answer 1

第一组括号将返回data.table，而不是原来的data.table，然后您将修改该grepl。要做到这一点 - 结合两个条件（注意使用grep而不是sbd_sbmolbio_n[grepl("MKTIIALSYIFCLVFA",ORF_SEQUENCE) & grepl("Signal Seq", N_TAG), N_TAG := sub("Signal Seq", "HA", N_TAG)] ）：

{{1}}