我正在运行monte-carlo模拟,输出格式为:
> d = data.frame(iter=seq(1, 2), k1 = c(0.2, 0.6), k2=c(0.3, 0.4))
> d
iter k1 k2
1 0.2 0.3
2 0.6 0.4
我想要生成的图是:
plot(d$iter, d$k1)
plot(density(d$k1))
我知道如何使用ggplot2进行等效绘图,转换为数据框
new_d = data.frame(iter=rep(d$iter, 2),
k = c(d$k1, d$k2),
label = rep(c('k1', 'k2'), each=2))
然后绘图很容易。然而,迭代次数可能非常大,并且k的数量也可能很大。这意味着搞乱一个非常大的数据框。
无论如何,我可以避免创建这个新数据框吗?
由于
答案 0 :(得分:15)
简短回答是“不”,你无法避免创建数据框。 ggplot
要求数据位于数据框中。如果使用qplot
,则可以为x和y分配不同的向量,但在内部,它仍然会根据传入的参数创建数据框。
我同意juba的建议 - 学会使用reshape
函数,或者更好的reshape
包含melt
/ cast
函数。一旦您快速将数据放入长格式,创建令人惊叹的ggplot
图形就会更近一步!
答案 1 :(得分:5)
是的,您可以避免创建数据框:只需为基础层ggplot()
提供一个空参数列表。以下是基于您的代码的完整示例:
库(GGPLOT2)
d = data.frame(iter=seq(1, 2), k1 = c(0.2, 0.6), k2=c(0.3, 0.4))
# desired plots:
# plot(d$iter, d$k1)
# plot(density(d$k1))
ggplot() + geom_point(aes(x = d$iter, y = d$k1))
# there is not enough data for a good density plot,
# but this is how you would do it:
ggplot() + geom_density(aes(d$k1))
请注意,虽然这允许你不创建数据框,但仍可能在内部创建数据框。例如,参见?geom_point
的以下摘录:
所有对象都将加固以生成数据框。
答案 2 :(得分:4)
您可以使用reshape
功能将数据框转换为“长”格式。可能比你的代码快一点吗?
R> reshape(d, direction="long",varying=list(c("k1","k2")),v.names="k",times=c("k1","k2"))
iter time k id
1.k1 1 k1 0.2 1
2.k1 2 k1 0.6 2
1.k2 1 k2 0.3 1
2.k2 2 k2 0.4 2
答案 3 :(得分:3)
所以只是添加到以前的答案。使用qplot,你可以做到
p <- qplot(y=d$k2, x=d$k1)
然后从那里进一步建造它,例如与
p + theme_bw()
但我同意 - 融化/演员通常是前进的方向。