使用ggmap截断密度多边形

时间:2013-12-10 03:56:21

标签: r ggplot2 ggmap

我无法使用R / ggmap绘制密度贴图。我的数据如下:

> head(W)
        date    lat     lon    dist
1 2010-01-01 31.942 -86.659 292.415
2 2010-01-10 32.970 -84.174  89.121
3 2010-01-17 31.000 -85.363 319.552
4 2010-01-17 31.457 -83.951 258.501
5 2010-01-17 31.073 -81.987 373.915
6 2010-01-17 33.210 -83.149 129.927

我正在用它绘图:

ggmap(atlanta.map, extent = "panel") +
  geom_point(data = W, aes(x = lon, y = lat)) +
  geom_density2d(data = W, aes(x = lon, y = lat)) +
  stat_density2d(data = W, aes(x = lon, y = lat, fill = ..level..,
    alpha = ..level..), size = 0.01, bins = 8, geom = 'polygon') +
  theme(axis.title = element_blank()) +
  scale_fill_gradient(low = "yellow", high = "red") +
  scale_alpha(range = c(.5, .75), guide = FALSE)

但是,尽管轮廓看起来很好并且一些多边形是可以的,但是与边界相交的多边形会分成两个部分:正确的“平滑”部分和关闭多边形的直线部分。这两个部分在地图的边界上相遇。

我的数据超出了地图的边界,因此KDE有足够的信息可以获得有意义的密度估计值,直到边界。

有人知道问题可能是什么吗?而且,更重要的是,我如何解决它?

谢谢, 安德鲁。

enter image description here

1 个答案:

答案 0 :(得分:3)

在SO上进行了一些谷歌搜索和搜索,我已经提出了一个解决方案。

ggmap(map, extent = "normal", maprange=FALSE) %+% W + aes(x = lon, y = lat) +
    geom_density2d() +
    stat_density2d(aes(fill = ..level.., alpha = ..level..),
                   size = 0.01, bins = 16, geom = 'polygon') +
    scale_fill_gradient(low = "green", high = "red") +
    scale_alpha(range = c(.00, .25), guide = FALSE) +
    coord_map(projection="mercator", 
              xlim=c(attr(map, "bb")$ll.lon, attr(map, "bb")$ur.lon),
              ylim=c(attr(map, "bb")$ll.lat, attr(map, "bb")$ur.lat)) +
    theme(legend.position = "none", axis.title = element_blank())