我有一个格式如下的文件:
AACCCGTAGATCCGAACTTGTG
ACCCGTAGATCCGAACTTGTG
CCGTAGATCCGAACTTGTG
CGTAGATCCGAACTTGT
我想使用awk为每一行提供一个标题,其中标题等于后面的行,如下所示:
>AACCCGTAGATCCGAACTTGTG
AACCCGTAGATCCGAACTTGTG
>ACCCGTAGATCCGAACTTGTG
ACCCGTAGATCCGAACTTGTG
>CCGTAGATCCGAACTTGTG
CCGTAGATCCGAACTTGTG
>CGTAGATCCGAACTTGT
CGTAGATCCGAACTTGT
答案 0 :(得分:2)
-v标志允许您设置变量。然后对于文件中的每一行打印变量后跟行,然后是行本身。
awk -v c=">" '{ print c $0; print $0; }' <file>
答案 1 :(得分:2)
简单地:
$ awk '{print ">"$0;print}' file
>AACCCGTAGATCCGAACTTGTG
AACCCGTAGATCCGAACTTGTG
>ACCCGTAGATCCGAACTTGTG
ACCCGTAGATCCGAACTTGTG
>CCGTAGATCCGAACTTGTG
CCGTAGATCCGAACTTGTG
>CGTAGATCCGAACTTGT
CGTAGATCCGAACTTGT
或者:
$ awk '{printf ">%s\n%s\n",$0,$0}' file
>AACCCGTAGATCCGAACTTGTG
AACCCGTAGATCCGAACTTGTG
>ACCCGTAGATCCGAACTTGTG
ACCCGTAGATCCGAACTTGTG
>CCGTAGATCCGAACTTGTG
CCGTAGATCCGAACTTGTG
>CGTAGATCCGAACTTGT
CGTAGATCCGAACTTGT