Question

我有这种格式的大型数据集

HF TLLL A T 0.999 NA 0.666 NA 0.566 NA NA 0.87
HF TLLM A T 0.500 0.500 0.666 0.566 NA NA 0.87

我想计算每一行的平均值，从第5列开始直到行尾，并忽略字符串NA。然后将平均值附加到每行的末尾。

输出如下：

HF TLLL A T 0.999 NA 0.666 NA 0.566 NA NA 0.87 0.775
HF TLLM A T 0.500 0.500 0.666 0.566 NA NA 0.87 0.620

我一直得到这样的总和，但无法弄清楚如何跟踪求和的整数数，以便计算平均值。

awk '{x=0;for(i=5;i<=NF;i++)x=x+$i;print $0, x}'

Answer 1

$ cat file
HF TLLL A T 0.999 NA 0.666 NA 0.566 NA NA 0.87
HF TLLM A T 0.500 0.500 0.666 0.566 NA NA 0.87
HF TLLM A T NA NA NA NA NA NA NA

$ awk '{sum=cnt=0; for (i=5;i<=NF;i++) if ($i != "NA") { sum+=$i; cnt++ } print $0, (cnt ? sum/cnt : "NA") }' file
HF TLLL A T 0.999 NA 0.666 NA 0.566 NA NA 0.87 0.77525
HF TLLM A T 0.500 0.500 0.666 0.566 NA NA 0.87 0.6204
HF TLLM A T NA NA NA NA NA NA NA NA

三元表达式避免了输入行3上的除零误差，其中每个数据字段都是＆＃34; NA＆＃34;。

Answer 2

kent$  awk '{s=n=0;for(i=5;i<=NF;i++)if($i!="NA"){s+=$i*1;n++}printf "%s %.3f\n",$0,s/n}' file
HF TLLL A T 0.999 NA 0.666 NA 0.566 NA NA 0.87 0.775
HF TLLM A T 0.500 0.500 0.666 0.566 NA NA 0.87 0.620

Answer 3

使用awk，您可以执行此操作：

awk '{for (i=5;i<=NF;i++) {if ($i!="NA") t++;a+=$i}print $0,a/t;a=t=0}' file
HF TLLL A T 0.999 NA 0.666 NA 0.566 NA NA 0.87 0.77525
HF TLLM A T 0.500 0.500 0.666 0.566 NA NA 0.87 0.6204

获得每条线的平均值

3 个答案: