Question

这有点令人困惑，提前道歉。我正在配置具有以下规范的新（临时）内部生产Web服务器：

OSX 10.8.4（Mountain Lion），Apache 2.2.25，PostgreSQL 9.2，Python 2.7.5，Django 1.5.2，R 3.0.1，RPy2 2.3.7，virtualenv 1.10.4，virtualenvwrapper 4.1.1， mod_wsgi 3.4

这是在使用Homebrew和pip的新机器上设置的。在进行安装之前，我删除了原始的，Apple安装的Apache和Postgres版本。 Apache和mod_wsgi都有效。安装mod_wsgi以作为守护进程运行。

在Apache中配置虚拟主机以通过mod_wsgi访问django，wsgi.py文件包含以下行：

import os,sys,site
site.addsitedir('/Users/kaiju/.virtualenvs/nauru_dev/lib/python2.7/site-packages')

# Activate the virtual environment
# Taken from http://thecodeship.com/deployment/deploy-django-apache-virtualenv-and-mod_wsgi/
activate_env = os.path.expanduser('/Users/kaiju/.virtualenvs/nauru_dev/bin/activate_this.py')
execfile(activate_env,dict(__file__=activate_env))

所有python包（包括django和RPy2）都是使用虚拟环境的python site-packages安装的。

使用Homebrew安装R，并且在虚拟环境中调用时可以从命令行或python解释器中正常工作（大部分时间，以后更多）。

homebrew.mxcl.httpd.plist已添加到/Library/LaunchDaemons而不是~/Library/LaunchAgents，以便在重新启动计算机时自动启动。已将homebrew.mxcl.postgres.plist添加到~/Library/LaunchAgents（可能还应将其移至/Library/LaunchDaemons）。

所以这是问题。当一切都安装好后，它就能很好地协同工作。为了验证一切都很酷，我重新启动了机器并测试了django应用程序。 Apache正在运行，django正在运行，但现在我收到以下错误：

RuntimeError at /admin/
R_HOME not defined, and no R command in the PATH.
     Request Method:    GET
        Request URL:    http://nauru.xoma.com/admin/
     Django Version:    1.5.2
     Exception Type:    RuntimeError
    Exception Value:    R_HOME not defined, and no R command in the PATH.
    Exception Location: /Users/kaiju/.virtualenvs/nauru_dev/lib/python2.7/site-packages/rpy2/rinterface/__init__.py in <module>, line 48
  Python Executable:    /usr/local/opt/python/bin/python2.7
     Python Version:    2.7.5
        Python Path:    ['usr/local/var/django/code/ri',
                         '/usr/local/var/django/code',
                         '/usr/local/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages/setuptools-0.9.8-py2.7.egg',
                         '/usr/local/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages/pip-1.4-py2.7.egg',
                         '/usr/local/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python27.zip',
                         '/usr/local/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7',
                         '/usr/local/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/plat-darwin',
                         '/usr/local/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/plat-mac',
                         '/usr/local/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/plat-mac/lib-scriptpackages',
                         '/usr/local/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/lib-tk',
                         '/usr/local/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/lib-old',
                         '/usr/local/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/lib-dynload',
                         '/usr/local/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages',
                         '/Library/Python/2.7/site-packages',
                         '/Users/kaiju/.virtualenvs/nauru_dev/lib/python2.7/site-packages',
                         '/Users/kaiju/.virtualenvs/nauru_dev/lib/python2.7/site-packages/PIL']

但如果我打开一个终端窗口并输入

sudo apachectl stop
sudo apachectl start

当服务器回来时，一切正常。如果我使用sudo apachectl restart，则不会发生这种情况，在这种情况下，错误仍然存在。到底是怎么回事？我的动作部件太多了。

Answer 1

解决此问题的最佳方法是添加

os.environ['R_HOME']='/usr/local/Cellar/r/3.0.1/R.framework/Resources'

到用于mod_wsgi / django的wsgi.py文件的开头。应在激活虚拟环境之前添加它。此处还应添加任何其他环境变量。所以现在wsgi.py文件看起来像这样：

import os,sys,site
os.environ["R_HOME"]='/usr/local/Cellar/r/3.0.1/R.framework/Resources'
site.addsitedir('/Users/kaiju/.virtualenvs/nauru_dev/lib/python2.7/site-packages')

# Activate the virtual environment
# Taken from http://thecodeship.com/deployment/deploy-django-apache-virtualenv-and-mod_wsgi/
activate_env = os.path.expanduser('/Users/kaiju/.virtualenvs/nauru_dev/bin/activate_this.py')
execfile(activate_env,dict(__file__=activate_env))

sys.path.insert(0,'/usr/local/var/django/code')
sys.path.insert(0,'/usr/local/var/django/code/ri')

# We defer to a DJANGO_SETTINGS_MODULE already in the environment. This breaks
# if running multiple sites in the same mod_wsgi process. To fix this, use
# mod_wsgi daemon mode with each site in its own daemon process, or use
# os.environ["DJANGO_SETTINGS_MODULE"] = "ri.settings"
os.environ.setdefault("DJANGO_SETTINGS_MODULE","ri.settings")

# This application object is used by any WSGI server configured to use this
# file. This includes Django's development server, if the WSGI_APPLICATION
# setting points here.
from django.core.wsgi import get_wsgi_application
application = get_wsgi_application()

非常感谢为此次讨论做出贡献的人们！

Answer 2

我认为sys.path与环境变量PATH几乎没有关系，它应该设置一个（如果需要的话还有LD_LIBRARY_PATH）。

我猜测Apache是作为专用用户运行的（出于明显的安全原因而不是您自己的UID），并且该用户的路径中没有R（其他安全步骤 - 默认情况下Apache不能运行任何在您的系统上执行。）

您必须允许Apache运行系统的R，或者仅为您的服务器安装R（如果考虑使用原型以外的任何东西，则后者会更好）

在virtualenv下加载RPy2时，Django无法找到R.

2 个答案: