2个数字列表之间的余弦相似度

时间:2013-08-24 23:37:21

标签: python python-3.x cosine-similarity

我需要计算两个列表之间的余弦相似度,例如,列表1是dataSetI,列表2是{{1} }。我不能使用诸如 numpy 或统计模块之类的东西。我必须使用通用模块(数学等)(以及尽可能少的模块,以减少花费的时间)。

假设dataSetIIdataSetI[3, 45, 7, 2]dataSetII。列表的长度总是相等。

当然,余弦相似度在 0和1 之间,并且为了它,它将用[2, 54, 13, 15]四舍五入到第三或第四位小数。

非常感谢您提前帮助。

15 个答案:

答案 0 :(得分:121)

您应该尝试SciPy。它有一堆有用的科学例程,例如“用数字计算积分,求解微分方程,优化和稀疏矩阵的例程”。它使用超高速优化的NumPy进行数字运算。有关安装,请参阅here

请注意,spatial.distance.cosine计算距离,而不是相似度。因此,您必须从1中减去该值才能获得相似性

from scipy import spatial

dataSetI = [3, 45, 7, 2]
dataSetII = [2, 54, 13, 15]
result = 1 - spatial.distance.cosine(dataSetI, dataSetII)

答案 1 :(得分:50)

您可以使用cosine_similarity功能表单sklearn.metrics.pairwise docs

In [23]: from sklearn.metrics.pairwise import cosine_similarity

In [24]: cosine_similarity([1, 0, -1], [-1,-1, 0])
Out[24]: array([[-0.5]])

答案 2 :(得分:50)

另一个版本仅基于numpy

from numpy import dot
from numpy.linalg import norm

cos_sim = dot(a, b)/(norm(a)*norm(b))

答案 3 :(得分:30)

我认为这里的表现并不重要,但我无法抗拒。 zip()函数完全重新复制两个向量(实际上更多的是矩阵转置),只是为了获得“Pythonic”顺序的数据。为实施细节和实施计划会很有趣:

import math
def cosine_similarity(v1,v2):
    "compute cosine similarity of v1 to v2: (v1 dot v2)/{||v1||*||v2||)"
    sumxx, sumxy, sumyy = 0, 0, 0
    for i in range(len(v1)):
        x = v1[i]; y = v2[i]
        sumxx += x*x
        sumyy += y*y
        sumxy += x*y
    return sumxy/math.sqrt(sumxx*sumyy)

v1,v2 = [3, 45, 7, 2], [2, 54, 13, 15]
print(v1, v2, cosine_similarity(v1,v2))

Output: [3, 45, 7, 2] [2, 54, 13, 15] 0.972284251712

通过一次一个地提取元素的C类噪声,但没有批量数组复制,并且在单个for循环中完成所有重要操作,并使用单个平方根。

ETA:更新了打印调用功能。 (原始版本是Python 2.7,而不是3.3。当前在Python 2.7下使用from __future__ import print_function语句运行。)无论哪种方式,输出都是相同的。

3.0GHz Core 2 Duo上的CPYthon 2.7.3:

>>> timeit.timeit("cosine_similarity(v1,v2)",setup="from __main__ import cosine_similarity, v1, v2")
2.4261788514654654
>>> timeit.timeit("cosine_measure(v1,v2)",setup="from __main__ import cosine_measure, v1, v2")
8.794677709375264

因此,在这种情况下,unpythonic方式快了大约3.6倍。

答案 4 :(得分:12)

我根据问题中的几个答案做了benchmark,以下片段被认为是最佳选择:

def dot_product2(v1, v2):
    return sum(map(operator.mul, v1, v2))


def vector_cos5(v1, v2):
    prod = dot_product2(v1, v2)
    len1 = math.sqrt(dot_product2(v1, v1))
    len2 = math.sqrt(dot_product2(v2, v2))
    return prod / (len1 * len2)

结果让我感到惊讶的是,基于scipy的实施并不是最快的。我分析并发现scipy中的余弦需要花费大量时间将一个向量从python列表转换为numpy数组。

enter image description here

答案 5 :(得分:10)

import math
from itertools import izip

def dot_product(v1, v2):
    return sum(map(lambda x: x[0] * x[1], izip(v1, v2)))

def cosine_measure(v1, v2):
    prod = dot_product(v1, v2)
    len1 = math.sqrt(dot_product(v1, v1))
    len2 = math.sqrt(dot_product(v2, v2))
    return prod / (len1 * len2)

您可以在计算后将其舍入:

cosine = format(round(cosine_measure(v1, v2), 3))

如果你想要它真的很短,你可以使用这个单线:

from math import sqrt
from itertools import izip

def cosine_measure(v1, v2):
    return (lambda (x, y, z): x / sqrt(y * z))(reduce(lambda x, y: (x[0] + y[0] * y[1], x[1] + y[0]**2, x[2] + y[1]**2), izip(v1, v2), (0, 0, 0)))

答案 6 :(得分:4)

不使用任何导入

  

math.sqrt(x)的

可以替换为

  

x ** .5

不使用numpy.dot(),你必须使用列表理解创建自己的点函数:

def cosine_similarity(a,b):
    return dot(a,b) / ( (dot(a,a) **.5) * (dot(b,b) ** .5) )

然后只是应用余弦相似公式的简单问题:

pip install tensorflow

答案 7 :(得分:3)

要计算的 Python 代码:

  • 余弦距离
  • 余弦相似度
  • 角距离
  • 角度相似性

import math

from scipy import spatial


def calculate_cosine_distance(a, b):
    cosine_distance = float(spatial.distance.cosine(a, b))
    return cosine_distance


def calculate_cosine_similarity(a, b):
    cosine_similarity = 1 - calculate_cosine_distance(a, b)
    return cosine_similarity


def calculate_angular_distance(a, b):
    cosine_similarity = calculate_cosine_similarity(a, b)
    angular_distance = math.acos(cosine_similarity) / math.pi
    return angular_distance


def calculate_angular_similarity(a, b):
    angular_similarity = 1 - calculate_angular_distance(a, b)
    return angular_similarity

答案 8 :(得分:2)

您可以使用简单的函数在Python中执行此操作:

def get_cosine(text1, text2):
  vec1 = text1
  vec2 = text2
  intersection = set(vec1.keys()) & set(vec2.keys())
  numerator = sum([vec1[x] * vec2[x] for x in intersection])
  sum1 = sum([vec1[x]**2 for x in vec1.keys()])
  sum2 = sum([vec2[x]**2 for x in vec2.keys()])
  denominator = math.sqrt(sum1) * math.sqrt(sum2)
  if not denominator:
     return 0.0
  else:
     return round(float(numerator) / denominator, 3)
dataSet1 = [3, 45, 7, 2]
dataSet2 = [2, 54, 13, 15]
get_cosine(dataSet1, dataSet2)

答案 9 :(得分:2)

使用numpy将一个数字列表与多个列表(矩阵)进行比较:

def cosine_similarity(vector,matrix):
   return ( np.sum(vector*matrix,axis=1) / ( np.sqrt(np.sum(matrix**2,axis=1)) * np.sqrt(np.sum(vector**2)) ) )[::-1]

答案 10 :(得分:1)

您可以使用此简单函数计算余弦相似度:

def cosine_similarity(a, b):
return sum([i*j for i,j in zip(a, b)])/(math.sqrt(sum([i*i for i in a]))* math.sqrt(sum([i*i for i in b])))

答案 11 :(得分:0)

如果您碰巧已经在使用PyTorch,则应该使用他们的CosineSimilarity implementation

假设您有两个nnumpy.ndarrayv1,即它们的形状均为v2。这就是它们的余弦相似度的方法:

(n,)

或者假设您有两个import torch import torch.nn as nn cos = nn.CosineSimilarity() cos(torch.tensor([v1]), torch.tensor([v2])).item() numpy.ndarray,它们的形状均为w1。以下内容为您提供了余弦相似度列表,每个都是w2中一行与(m, n)中相应行之间的余弦相似性:

w1

答案 12 :(得分:0)

另一种版本,如果您有一个向量列表和一个查询向量的场景,并且想要计算列表中所有向量的查询向量的余弦相似度,则可以在下面一次性完成时尚:

>>> import numpy as np

>>> A      # list of vectors, shape -> m x n
array([[ 3, 45,  7,  2],
       [ 1, 23,  3,  4]])

>>> B      # query vector, shape -> 1 x n
array([ 2, 54, 13, 15])

>>> similarity_scores = A.dot(B)/ (np.linalg.norm(A, axis=1) * np.linalg.norm(B))

>>> similarity_scores
array([0.97228425, 0.99026919])

答案 13 :(得分:0)

我们可以使用简单的数学方程轻松计算余弦相似度。 Cosine_similarity = 1-(向量的点积/(向量范数的乘积))。我们可以分别定义两个函数来计算点积和范数。

def dprod(a,b):
    sum=0
    for i in range(len(a)):
        sum+=a[i]*b[i]
    return sum

def norm(a):

    norm=0
    for i in range(len(a)):
    norm+=a[i]**2
    return norm**0.5

    cosine_a_b = 1-(dprod(a,b)/(norm(a)*norm(b)))

答案 14 :(得分:-3)

对于不能使用NumPy的情况,所有答案都非常有用。如果可以的话,这是另一种方法:

def cosine(x, y):
    dot_products = np.dot(x, y.T)
    norm_products = np.linalg.norm(x) * np.linalg.norm(y)
    return dot_products / (norm_products + EPSILON)

还要牢记EPSILON = 1e-07来确保分裂。