我对Python很陌生,所以任何帮助都会受到赞赏。我试图在Linux上使用mdbtools
从2000 .mdb文件中提取和排序数据。到目前为止,我只能获取.mdb文件并将所有表转储到.csv中。由于需要处理大量文件,因此会造成巨大的混乱。
我需要从特定表中提取特定的排序数据。例如,我需要名为“Voltage”的表。该表由多个循环组成,每个循环也有几行。循环通常按时间顺序排列,但在某些情况下,时间戳会延迟记录。像循环一样,第一行可以比循环1第一行具有更晚的时间。我需要根据第一个或最后五个周期的时间提取周期的最新一行。例如,在下表中,我将需要第二行。
Cycle# Time Data
1 100.59 34
1 101.34 54
1 98.78 45
2
2
2 ...........
这是我使用的脚本。我正在使用命令python extract.py table_files.mdb.
但我希望用./extract.py调用该脚本。文件名的路径应该在脚本本身。
import sys, subprocess, os
DATABASE = sys.argv[1]
subprocess.call(["mdb-schema", DATABASE, "mysql"])
# Get the list of table names with "mdb-tables"
table_names = subprocess.Popen(["mdb-tables", "-1", DATABASE],
stdout=subprocess.PIPE).communicate()[0]
tables = table_names.splitlines()
print "BEGIN;" # start a transaction, speeds things up when importing
sys.stdout.flush()
# Dump each table as a CSV file using "mdb-export",
# converting " " in table names to "_" for the CSV filenames.
for table in tables:
if table != '':
filename = table.replace(" ","_") + ".csv"
file = open(filename, 'w')
print("Dumping " + table)
contents = subprocess.Popen(["mdb-export", DATABASE, table],
stdout=subprocess.PIPE).communicate()[0]
file.write(contents)
file.close()
答案 0 :(得分:3)
就个人而言,我不会花费大量时间来试图让mdbtools
,unixODBC
和pyodbc
一起工作。正如Pedro在他的评论中所建议的那样,如果你可以让mdb-export
将表转储到CSV文件,那么你可以通过将这些CSV文件导入SQLite或MySQL来节省相当多的时间,即比在Linux平台上使用mdbtools
更强大。
一些建议:
考虑到所涉及的.mdb
个文件(以及.csv
个文件)的数量庞大,您可能希望将CSV数据导入到一个带有附加列的大表中,以指示源文件名。这比2000个单独的表格更容易管理。
在新数据库中创建目标表时,您可能希望为[时间]列使用decimal
(而不是float
)数据类型。
同时,将[Cycle#]列重命名为[Cycle]。列名中的“有趣字符”可能是一种真正的麻烦。
最后,要为给定[SourceFile]和[Cycle]选择“最后”读数(最大[时间]值),您可以使用如下查询:
SELECT
v1.SourceFile,
v1.Cycle,
v1.Time,
v1.Data
FROM
Voltage v1
INNER JOIN
(
SELECT
SourceFile,
Cycle,
MAX([Time]) AS MaxTime
FROM Voltage
GROUP BY SourceFile, Cycle
) v2
ON v1.SourceFile=v2.SourceFile
AND v1.Cycle=v2.Cycle
AND v1.Time=v2.MaxTime
答案 1 :(得分:0)
为了将它直接带到python3中的Pandas,我写了这个小片段
import sys, subprocess, os
from io import StringIO
import pandas as pd
VERBOSE = True
def mdb_to_pandas(database_path):
subprocess.call(["mdb-schema", database_path, "mysql"])
# Get the list of table names with "mdb-tables"
table_names = subprocess.Popen(["mdb-tables", "-1", database_path],
stdout=subprocess.PIPE).communicate()[0]
tables = table_names.splitlines()
sys.stdout.flush()
# Dump each table as a stringio using "mdb-export",
out_tables = {}
for rtable in tables:
table = rtable.decode()
if VERBOSE: print('running table:',table)
if table != '':
if VERBOSE: print("Dumping " + table)
contents = subprocess.Popen(["mdb-export", database_path, table],
stdout=subprocess.PIPE).communicate()[0]
temp_io = StringIO(contents.decode())
print(table, temp_io)
out_tables[table] = pd.read_csv(temp_io)
return out_tables