Question

美好的一天。

我使用Grep根据ID文件的模式从文件中提取读数。

grep -w -f idFile.txt readingFile.txt

我获得的Grep I的输出是：

F47807  0.00    0.00    8.30
R02218  0.00    0.00    2.07
W74941  0.00    0.00    5.70
C15915  0.00    0.00    3.63
C16638  0.00    0.39    8.82
C16979  0.00    0.39    2.59

假设ID文件是：

我想让Grep输出与ID文件相同的模式，如下所示：

W74941  0.00    0.00    5.70
F47807  0.00    0.00    8.30
C15915  0.00    0.00    3.63
R02218  0.00    0.00    2.07
C16638  0.00    0.39    8.82
C16979  0.00    0.39    2.59

我试过几个Grep选项，但我没能得到我想要的东西。因此，请社区请您给我一些建议我该怎么做？

非常感谢你的时间。

Answer 1

我不知道你是否只能用grep来做这件事，但是如果你使用了一些bash，你可以这样做：

for line in $(cat idFile.txt)
    do grep "$line" readingFile.txt
done

对于每个id，这将覆盖一次readFile，所以如果表现出来担心，这对你没有帮助。

编辑：请注意，这假设id不包含空格。

Answer 2

稍微awk你可以做这样的事情 -

awk 'NR==FNR {
    a[$1]=$0
    next 
} 
($1 in a) { 
    print a[$1] 
}' <(grep -w -f idFile.txt readingFile.txt) idfile

阐释：

awk是/pattern/ {action}语句的组合。我们的第一个模式NR==FNR确保我们的操作仅在传递给awk的第一个文件上执行（在我们的例子中是grep输出）。
我们的action就是将它存储在一个数组中。
第一个文件完成后，我们的模式将变为false，第二个pattern-action语句将生效。
第二个pattern-action语句检查您的idfile的第一个条目是否存在于数组中。如果是，则打印出来。因此，您可以根据idfile中的序列获得输出。

Answer 3

这个单行应该使用你的grep输出和idfile：

awk 'NR==FNR{a[$1]=$0;next}$1 in a&&$0=a[$1]'

完整的一行：

awk 'NR==FNR{a[$1]=$0;next}$1 in a&&$0=a[$1]' <(grep -w -f idFile.txt readingFile.txt) idfile

如何让Grep的输出与文件中的模式相同？

3 个答案:

阐释：