在R中用分位数绘图

时间:2013-03-31 18:13:40

标签: r ggplot2

我想绘制foo ~ bar。但是,我不想查看确切的数据,我宁愿将bar分解为分位数,并为每个分位数绘制mean(foo)(因此我的最终绘图将有5个数据点)。这可能吗?

2 个答案:

答案 0 :(得分:6)

 foo <- rnorm(100)
 bar <- rnorm(100)

  mn.foo.byQ10bar <- tapply(foo, cut(bar, quantile(bar, (0:5)/5, na.rm=TRUE)), mean)

> mn.foo.byQ5bar
 (-3.31,-0.972] (-0.972,-0.343]  (-0.343,0.317]   (0.317,0.792]    (0.792,2.71] 
     0.13977839      0.03281258     -0.18243804     -0.14242885     -0.01696712 

 plot(mn.foo.byQ5bar)

这是一个相当标准的任务,Harrell的Hmisc包的cut2函数有一个很好的gr =参数,只需为组数指定一个整数即可。我也喜欢它,因为切割操作的间隔是左关闭而不是R默认为右关闭。

答案 1 :(得分:5)

你可以将很多这些行组合成更简洁的代码,但在这里它被分解

# Sample Data: 
x <- 1:100;   y <- rnorm(x)

# Number Of Groups
N <- 5

# quantiles
Q.y <- quantile(y, probs=seq(0, 1, length=(N+1)))
Q.x <- quantile(x, probs=seq(0, 1, length=N))

# means of y by quantile
means.y <- c(by(y, cut(y, Q.y), mean))

# plot them 
qplot(Q.x, means.y)