Question

是否存在使用并行计算的R中矩阵求逆的包？

谢谢！

您好。我在安装HiPLARb软件包时遇到问题，这就是我所做的：

下载自动安装程序脚本：http://www.hiplar.org/downloads/HiPLARb.Installer

./HiPLARb.Installer --with-openblas --no-gpu --prefix=/home/kaiyin/mylib 一切顺利，所有的先决条件库都已成功安装，也是R 2.15.2的修补版本

从http://www.hiplar.org/downloads/HiPLARb_0.1.3.tar.gz

下载该软件包

修改shell PATH以添加修补的R bin目录。

R CMD INSTALL --configure-args="--with-lapack= \ 
-L/home/kaiyin/mylib/lib\ -lopenblas \ 
--with-plasma-lib=/home/kaiyin/mylib \ 
--with-magma-lib=/home/kaiyin/mylib" HiPLARb_0.1.3.tar.gz

我收到以下错误：

configure：错误：无法识别的选项：`-L / home / kaiyin / mylib / lib -lopenblas'

尝试`./configure --help'获取更多信息

错误：包HiPLARb的配置失败

请帮助，谢谢！

由于-lopenblas不是有效的配置选项，我将其删除并重试：

R CMD INSTALL --configure-args="--with-lapack=/home/kaiyin/mylib/lib\
--with-plasma-lib=/home/kaiyin/mylib \ 
--with-magma-lib=/home/kaiyin/mylib" ../HiPLARb_0.1.3.tar.gz

这次是一个新错误：

configure: error: invalid variable name: ` --with-magma-lib'

第3次尝试：

R CMD INSTALL --configure-args="--with-lapack=/home/kaiyin/mylib/lib\
--with-plasma\
--with-magma\ 
--with-plasma-lib=/home/kaiyin/mylib \ 
--with-magma-lib=/home/kaiyin/mylib" ../HiPLARb_0.1.3.tar.gz 

configure: WARNING: you should use --build, --host, --target
configure: WARNING: invalid host type:  
checking "if PLASMA libraries exist"... configure: WARNING: "No PLASMA option given."
configure: WARNING: "No CUDA option given."
configure: WARNING: "No MAGMA option given."
configure: error: Cannot find MAGMA or PLASMA Libraries. Please install MAGMA, PLASMA or both. Please see the install guide for more details.

Answer 1

是的，好几个;但这取决于平行的意思。

如果你的意思是非常大规模的并行性，就像不适合单个机器而你需要一个集群来处理它，那么就有PBD packages。这些需要安装MPI和Scalapack等软件包，但它们通常可用于任何用于大型技术计算的集群。

如果矩阵适合单个节点并且您只想将所有CPU丢弃，那么HiPLAR包可以使用基于PLASMA或MAGMA库的多个cpus甚至GPU（再次需要安装）。

更一般地说，CRAN HPC task view是这些类型包的有用列表。

Answer 2

为了在R中并行计算，有几个包

看看这个PDF：充分利用你的CPU R 中的并行计算策略

这里有一个网站High-Performance and Parallel Computing with R，其中报告了几个关于R

中并行计算的软件包

R中是否存在并行矩阵求逆的包

2 个答案: