如何使用python // Matplotlib重新创建此图形？

Question

我想重新创建这样的东西：

但使用我自己的数据。我的数据如下：

 Number    Name1        Structure        mean    stdev
 1         Aldehydes    RCH=O       122.76    7.67
 2         Ketones          R2C=O       8.11      0.15
 2         Amides       R-CONr2     20.1      83.24

如何重新创建此情节？我得到了：

from pylab import *
import numpy  
data = numpy.genfromtxt('data',unpack=True,names=True,dtype=None) 
pos = arange(size(data['Number']))
ax2.errorbar(pos,data['mean'], yerr=data['stdev'])

但我无法让这个情节与我的榜样相似。有人可以为此发布示例代码吗？

Answer 1

您可以首先将数据绘制为误差条，然后使用相应的文本进行注释。

以下是一个简单的代码：

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt

data = np.genfromtxt('data.txt', unpack=True,names=True,dtype=None)

fig, ax = plt.subplots()
ax.set_yticklabels([])
ax.set_xlabel(r'ppm ($\delta$)')
pos = np.arange(len(data))
#invert y axis so 1 is at the top
ax.set_ylim(pos[-1]+1, pos[0]-1)
ax.errorbar(data['mean'], pos, xerr=data['stdev'], fmt=None)

for i,(name,struct) in enumerate(zip(data['Name1'], data['Structure'])):
    ax.text(data['mean'][i], i-0.06, "%s, %s" %(name, struct), color='k', ha='center')

plt.show()

更改注释中单个字母的颜色将非常棘手，因为matplotlib不支持多色文本。我试图找到一个解决方法，使用正则表达式来注释两次相同的文本（一个只有红色的“C”和没有“C”的一个），但因为每个字母不占用相同的空间，它不会所有单词都能很好地工作（见下文）。

#add to the import
import re

#and change
for i,(name,struct) in enumerate(zip(data['Name1'], data['Structure'])):
    text_b = ax.text(data['mean'][i], i-0.05, "%s, %s" %(name, struct), color='k', ha='center')
    text_b.set_text(text_b.get_text().replace('C', '   '))
    text_r = ax.text(data['mean'][i], i-0.05, "%s %s" %(name, struct), color='r', ha='center')
    text_r.set_text(re.sub('[abd-zABD-Z]', '  ', text_r.get_text()))
    text_r.set_text(re.sub('[0-9\=\-\W]', ' ', text_r.get_text()))