Question

如果np.fromfile（）有最大文件大小？我正在尝试读取一个48GB的文件，大约有2.1e9条记录（每条记录有5个值）。

当我将计数限制为8e7时，它会起作用：

fromfile(filename, dtp, int(8e7))
Out[69]: 
array([(1, 244025.0, 1.1666666269302368, 360.1666564941406, 50.0),
       (2, 244025.0, 1.1666666269302368, 360.5, 50.0),
       (3, 244025.0, 1.1666666269302368, 360.8333435058594, 50.0), ...,
       (255138, 244131.0, 1128.9346923828125, 461.38494873046875, 49.5),
       (255139, 244131.0, 1143.77783203125, 473.2532958984375, 49.5),
       (255140, 244131.0, 1150.4803466796875, 464.6799011230469, 49.5)], 
      dtype=[('ntrac', '<i4'), ('ints', '<f8'), ('x', '<f4'), ('y', '<f4'), ('z', '<f4')])

但是当计数设置为9e7时，所有值都被读为零：

In [70]: fromfile(filename, dtp, int(9e7))
Out[70]: 
array([(0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0), (0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0),
       (0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0), ..., (0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0),
       (0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0), (0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0)], 
      dtype=[('ntrac', '<i4'), ('ints', '<f8'), ('x', '<f4'), ('y', '<f4'), ('z', '<f4')])

Answer 1

这可能是Mac OSX的fread（）例程中的一个错误。 fwrite（）例程确实有类似的错误：https://github.com/numpy/numpy/issues/574

您可以通过编写一个简单的C测试程序（例如那里附带的票证）进行检查，然后向Apple投诉......

解决方法是以足够小的块读取文件。

编辑：过快读取错误报告--- fwrite（）错误并不完全相似，但我认为不能排除操作系统错误......

Answer 2

看起来它确实是Mac OS X的一个错误。

请参阅numpy中的以下错误：https://github.com/numpy/numpy/issues/2806

我在分支的分支中有一个建议的修复，有助于某人验证它，请参阅： https://github.com/sauliusl/numpy/tree/bug_large_save

使用np.fromfile的文件大小的最大限制？

2 个答案: