如何将file1的每一列附加到file2的特定字段并创建一个新的输出文件?

时间:2012-11-05 21:30:39

标签: linux bash loops awk

我想将文件1的每一列附加为文件2的第4列,并将其作为新文件导出,其中包含文件1中的列号或类似于输出名称的列号。

输入文件1和2具有相同的行数:

输入文件1有N列:

12 23 34  .....
33 34 23
67 09 34
45 67 34
65 76 44
64 33 96

输入文件2最初有5列

AA BB FF DD 6
AA CC HH NN 7
AA DD II RR 4
AA EE JJ PP 2
AA FF KK QQ 9
AA GG LL SS 8

例如,前3个输出文件如下所示:

输出文件1(第1列):

AA BB FF 12 DD 6
AA CC HH 33 NN 7
AA DD II 67 RR 4
AA EE JJ 45 PP 2
AA FF KK 65 QQ 9
AA GG LL 64 SS 8

输出文件2(第2列):

AA BB FF 23 DD 6
AA CC HH 34 NN 7
AA DD II 09 RR 4
AA EE JJ 67 PP 2
AA FF KK 76 QQ 9
AA GG LL 33 SS 8

输出文件3(第3列):

AA BB FF 34 DD 6
AA CC HH 23 NN 7
AA DD II 34 RR 4
AA EE JJ 34 PP 2
AA FF KK 44 QQ 9
AA GG LL 96 SS 8

新文件名可以是file1,file2,file3 ...或column1,column2,column3 ....或类似的东西。我怎么能实现这个目标呢? (for loop,awk,paste等)

任何建议都将不胜感激。

3 个答案:

答案 0 :(得分:3)

如果您的列以制表符分隔,则可以轻松从cutpaste中获利:

for i in {1..N} ; do  # Insert the real N here, or change to $(seq 1 $N)
    cut -f1-3 input2 | \
        paste - \
              <(cut -f$i input1) \
              <(cut -f4- input2) \
        > output$i
done

答案 1 :(得分:1)

此方法仅处理每个文件一次,如果文件很大,这是一个帮助。但是,它确实需要将第一个文件存储在内存中:

awk '
    NR==1 {n=NF} 
    NR==FNR {
        for (i=1; i<=n; i++) 
            file1[i, FNR]=$i
        next
    }
    {
        for (i=1; i<=n; i++) {
            filename = "merged" i
            print $1, $2, $3, file1[i, FNR], $4, $5 >> filename
        }
    }
' file1 file2

答案 2 :(得分:1)

这就是你需要的东西:

awk '
NR==FNR { hd=$1" "$2" "$3"; tl=$4" "$5; next }
{  for (i=1;i<=NF;i++) {
      print hd, $i, tl > "file" i
   }
}
' file2 file1