我期待从dicom文件中将3D矩阵可视化到matlab中。由于我对matlab不太熟悉,我设法从this post获得了帮助:
不同之处在于我的矩阵不是由1和0组成,而是由imshow(dicomeread(dicomFile))
如何使用3D渲染获得相同的对比度?
我的代码:
dicomFilesZm = dir(fullfile(myDcmFolder, 'SLZ-*.dcm')); %Get files name
dicomFilesZp = dir(fullfile(myDcmFolder, 'SLZ+*.dcm')); %~
Z = dicomFilesZm(end:-1:1); % sort
dicomFilesZ = [Z ; dicomFilesZp]; % recompose final array with files name
Iz1 = fullfile(myDcmFolder, dicomFilesZ(1).name);
v = NaN([size(dicomread(Iz1)) numel(dicomFilesZ)]); % creation of empty matrix with the good size
for i = 1 : numel(dicomFilesZ)
Iz = fullfile(myDcmFolder, dicomFilesZ(i).name);
v(:,:,i) = dicomread(Iz); % fill the matrix with each image
end
p = patch( isosurface(v,0) );
isonormals(v, p)
set(p, 'FaceColor','r', 'EdgeColor','none')
daspect([1 1 1])
感谢您的帮助。
答案 0 :(得分:3)
解决问题的两个选项:
天真地,你为什么不设置v=v+min(v(:))
所以图像会从零扩展到不同的最大值?
为什么带有负isovlaue的isosurface(V,isovalue)
不会为您解决此问题?
或者,如果你想要从(-n:step_size:m)的isovalues循环获得你想要的动态范围(用一些alpha(0.2)
来查看你想要的图层)