Question

问题：使用gdata

将.xls读入R时助手失败

我有一些.xls，我想读入R.我可以使用read.xls包中的gdata来执行此操作，但帮助函数sheetNames和{ {1}}失败 - 我想了解我做错了什么，以便我可以使用它们，因为它们非常有用。

sheetCount

当我知道工作表的结构，并且能够将其指向我的预期数据表时，perl脚本运行得很好：

require(gdata)
fp <- file.path('~/data/first.xls')

我的数据在firstdata <- read.xls(fp, sheet=2)中。

然而，在同一张纸上，助手失败了。

我发现自己在excel中打开.xls，搞清楚，然后使用firstdata加载到R中 - 不是灾难，但它也不理想。

特别是，当工作表不是我自己的，并且我需要有关他们的信息才能在read.xls(fp, sheet=N)中设置sheet=N，帮助函数read.xls()和sheetNames会非常有用，但是它们会失败 - 为什么？

sheetCount

和

sheetCount(fp)

> sheetNames(fp)
Error in read.table(tc, as.is = TRUE, header = FALSE) : 
  no lines available in input
In addition: Warning message:
running command ''/usr/bin/perl'     '~/R/wd/raRpackages/gdata/perl/sheetNames.pl' '~/data/first.xls'' had status 2 
Unable to open file '~/data/first.xls'.

经过一番摆弄后，我（非常偶然）发现使用完整路径解决了这个问题：

> sheetCount(fp)
Error in read.table(tc, as.is = TRUE, header = FALSE) :  
  no lines available in input
In addition: Warning message:
running command ''/usr/bin/perl'     '~/R/wd/raRpackages/gdata/perl/sheetCount.pl' '~/data/first.xls'' had status 2 
Unable to open file '~/data/first.xls'.

Answer 1

看起来~未扩展到您的主目录。这种扩展通常由shell完成，因此R可能不会这样做，perl绝对不会。

相反，请在Perl程序中使用显式路径或$HOME或$ENV{HOME}。

使用R包gdata时的PATH规范

1 个答案: