Question

我处理的问题（显示的示例是高度简化的）似乎是一个常见的问题，但我还没有找到解决方案。我有三个不同的反应，v1，v2和v3，定义如下：

v1：R - ＆lt; - ＆gt; A + C; v1 = k1 *（R - A * C / 5000。）

v2：R - > B + C; v2 = k2 *（R - B * C / 5000。）

v3：A + B - ＆gt; P： v3 = k3 * A * B

使用资源R，前两个反应分别产生A和C以及B和C，而第三个反应将A和B转换为产品P（k1，k2，k3是常数，这里它们设置为1 ）。

第三个反应只有在C超过某个叫做Cthr的阈值（此处：Cthr = 25）时才会发生，否则v3为0.所以我想这个C会累积，然后，一旦达到一定的浓度，就会产生结果在产品P的生产中。

我实现了如下：

def thresholdmodel (yn,tvec,allpara,R):

    (A, B, C, P) = yn

    k1, k2, k3 = allpara['kv']    

    Cthr = allpara['Cthresh']

    if C <= Cthr:
        v3 = 0
    else:      
        v3 = k3*A*B
        C = 0 #does not(!) affect the ouput, why?

    v1 = k1*(R - A*C/5000.)
    v2 = k2*(R - B*C/5000.)

    dA = v1 - v3
    dB = v2 - v3
    dC = v1 + v2
    dP = v3

    return (dA, dB, dC, dP)

模拟的输出如下所示：http://i50.tinypic.com/apdvkj.png

所以显然它一直工作，直到第一次达到阈值（v3为0，P没有产生），但之后C没有设置为0，我不明白为什么。
我想得到的是：C产生直到阈值，下降到0，再次产生，下降到0，依此类推，看起来像锯齿波。
P的时间过程应该看起来像楼梯（仅在超过Cthr时产生）。

有人知道我要做什么才能将C设置回0并接收预期的输出？非常感谢！

Answer 1

我不明白你的方程式，但我可以说明为什么C不会降到0。

由于C是thresholdmodel()中的本地变量，因此将C更改为任何值都不会更改odeint中的状态。 odeint将始终整合dC返回的thresholdmodel()。因此C会不断增加。

编辑：

C将持续增加，因此每次C> 1时都需要更改阈值。阈值，例如：

lastC = 0

def thresholdmodel (yn,tvec,allpara,R):
    global lastC
    (A, B, C, P) = yn

    k1, k2, k3 = allpara['kv']    

    Cthr = allpara['Cthresh']

    if C <= lastC + Cthr:
        v3 = 0
    else:      
        v3 = k3*A*B
        lastC = C

    v1 = k1*(R - A*C/5000.)
    v2 = k2*(R - B*C/5000.)

    dA = v1 - v3
    dB = v2 - v3
    dC = v1 + v2
    dP = v3

    return (dA, dB, dC, dP)

Python：使用odeint实现阈值模型

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