Question

所以我的问题是，当其中一个代码无法在服务器中找到该文件时，我的代码会崩溃。有没有办法在找不到文件时跳过查找过程并继续循环。以下是我的代码：

fname = '/Volumes/database/interpro/data/'+uniprotID+'.txt'



for index, (start, end) in enumerate(searchPFAM(fname)):
        with open('output_'+uniprotID+'-%s.txt' % index,'w') as fileinput:
            print start, end
            for item in lookup[uniprotID]:
                item, start, end = map(int, (item, start, end)) #make sure that all value is int
                if start <= item <= end:
                    print item
                    result = str(item - start)
                    fileinput.write(">{0} | at position {1} \n".format(uniprotID, result))
                    fileinput.write(''.join(makeList[start-1:end]))
                    break
            else:
                    fileinput.write(">{0} | N/A\n".format(uniprotID))
                    fileinput.write(''.join(makeList[start-1:end]))

for index, (start, end) in enumerate(searchPFAM(fname)): with open('output_'+uniprotID+'-%s.txt' % index,'w') as fileinput: print start, end for item in lookup[uniprotID]: item, start, end = map(int, (item, start, end)) #make sure that all value is int if start <= item <= end: print item result = str(item - start) fileinput.write(">{0} | at position {1} \n".format(uniprotID, result)) fileinput.write(''.join(makeList[start-1:end])) break else: fileinput.write(">{0} | N/A\n".format(uniprotID)) fileinput.write(''.join(makeList[start-1:end]))

Answer 1

您需要使用try / except块来处理异常。请参阅handling exceptions的Python文档。

在这种情况下，您必须使用open()打包with调用（以及try阻止中的所有内容），并使用except IOError捕获异常：

for ...
    try:
        with open(...
           # do stuff
    except IOError:
        # what to do if file not found, or pass

其他信息

你真正应该做的是将外部for循环的主体拉出一个函数。或者可能是with的主体，进入处理打开文件的函数。无论哪种方式，减少嵌套都会使事情更具可读性，并且更容易进行这样的更改，添加try / except。

实际上，您似乎在外部for循环的每次迭代中重新打开文件，但文件名永远不会更改 - 您总是重新打开同一个文件。这是故意的吗？如果没有，你可能想重新思考你的逻辑，并将其移出循环。

第三个想法，你得到的例外是什么？是不是找不到IOError的文件？因为您正在打开文件（'w'），所以我不知道为什么你会得到那个例外。

Answer 2

for index, (start, end) in enumerate(searchPFAM(fname)):
    try:
        newname = 'output_'+uniprotID+'-%s.txt' % index
        with open(newname,'w') as fileinput:
            print start, end
            for item in lookup[uniprotID]:
                item, start, end = map(int, (item, start, end)) #make sure that all value is int
                if start <= item <= end:
                    print item
                    result = str(item - start)
                    fileinput.write(">{0} | at position {1} \n".format(uniprotID, result))
                    fileinput.write(''.join(makeList[start-1:end]))
                    break
                else:
                    fileinput.write(">{0} | N/A\n".format(uniprotID))
                    fileinput.write(''.join(makeList[start-1:end]))
    except IOError:
        print 'Couldn't find file %s' % newname

在服务器上找不到文件时停止代码崩溃的方法？

2 个答案: