我正在尝试在我的笔记本电脑上安装PETSc-3.2(MacBook Pro 10.5.8,MPICH2-1.1),并且在运行测试时遇到了一些困难:它从系统调用错误getdomainname()
返回一个错误的地址。
[-1]PETSC ERROR: --------------------- Error Message ------------------
[-1]PETSC ERROR: Error in system call!
[-1]PETSC ERROR: getdomainname()!
[-1]PETSC ERROR: ------------------------------------------------------
为了调查,我编写了以下测试代码来检查带有和不带MPI的getdomainname()
的功能:
单处理器:
#include <unistd.h>
#include <stdio.h>
#include <errno.h>
#include <string.h>
#include <limits.h>
#include <stdlib.h>
int main(int argc, char **argv)
{
char *name;
int namelen = CHAR_MAX;
name = (char*) calloc (namelen,sizeof(char));
int err = getdomainname(name,namelen);
printf("%s\n",strerror(errno));
printf("Domain name: %s\n",name);
return err;
}
并行:
/* Headers */
#include "mpi.h"
int main(int argc, char **argv)
{
MPI_Init(&argc,&argv);
int myrank;
char *mpi_name;
int mpi_namelen = MPI_MAX_PROCESSOR_NAME;
mpi_name = (char*) calloc (mpi_namelen,sizeof(char));
MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD,&myrank);
int mpi_err = MPI_Get_processor_name(mpi_name,&mpi_namelen);
printf("MPI_Get_processor_name [%d]: %s\n",mpi_err,mpi_name);
char *name;
int namelen = CHAR_MAX;
name = (char*) calloc (namelen,sizeof(char));
int err = getdomainname(name,namelen);
printf("%s\n",strerror(errno));
printf("Domain name: %s\n",name);
return err;
MPI_Finalize();
}
单处理器代码没有问题,并行代码获取处理器的正确名称,但即使与getdomainname()
一起运行,也会在调用mpirun -np 1
时返回错误地址。
有没有人遇到这样的问题?我是否需要为mpirun
进行某种配置,以便为MPI生成的每个进程设置域名?提前谢谢!
对于那些使用PETSc遇到此问题的人,请使用选项--with-debugging=0
进行编译。似乎在一些PETSc调试消息等中,他们使用getdomainname()
而不是MPI_Get_processor_name()
。在没有调试的情况下进行编译会禁用库中的此分支。
答案 0 :(得分:2)
尝试更新版本的MPICH2,1.1很老。除非您要求,否则当前版本不应向-m32
添加任何-m64
/ mpicc
个参数。 (我不确定旧版本是否也这样做,但这是可能的)