Question

当运行valgrind来检测mpi应用程序中的错误时，我收到以下错误：

libmpi.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory

我发现了以下内容： Valgrind documentation（第4.9.1节）声明“要包装的MPI函数假定在一个ELF共享对象中，其子语名与libmpi.so *匹配。至少对于Open MPI和Quadrics来说，这是正确的。 MPI，如果需要可以轻松更改。“

因为我使用mpich2，它实际上应该使用libmpich.so.1.0。

这可以在libmpiwrap.c中看到：

#include "mpi.h"

/* Where are API symbols?
Open MPI      lib/libmpi.so,   soname = libmpi.so.0
Quadrics MPI  lib/libmpi.so,   soname = libmpi.so.0
MPICH         libmpich.so.1.0, soname = libmpich.so.1.0

A suitable soname to match with is therefore "libmpi*.so*".

我的问题是：我在哪里以及如何配置？

Answer 1

我自己有这个问题。希望这可以指出你正确的方向。不幸的是，MPI很难与valgrind和gdb一起工作。

选项1 ：找到合适的包。

在Fedora / RHEL /（基于rpm）系统上，您可以在valgrind-openmpi包中找到OpenMPI共享库。我找不到MPICH版本。我使用MVAPICH，所以这对我没有帮助。如果您找到MPICH / MVAPICH版本，请发表评论，以便我可以在此处添加。

Valgrind OpenMPI

PBone将内容显示为拥有libmpiwrapper共享对象。

选项2 ：从源代码构建库。（我为MVAPICH做了什么）

我求助于从源代码编译valgrind，然后复制共享库。我想保留包管理器的valgrind版本，所以我只是匹配源代码的版本并使用默认的GCC是安全的。你可以使用最新的和最好的，但我怀疑你得到了多少。

构建Valgrind时，需要确保找到正确的MPI安装。检查输出以验证正确的共享库和头文件。我习惯在系统上安装多个MPI，所以这是我学到的难点。花一些时间在autoconf / automake输出上。幸运的是，Valgrind维护人员在保持构建非常简单方面做得很好，所以我没有遇到任何重大问题的编译。

源代码 http://valgrind.org/downloads/

一旦拥有它，关键就是设置env变量，正如他们在文档中提到的那样。

附加说明 - https://wiki.mpich.org/mpich/index.php/Support_for_Debugging_Memory_Allocation - https://fs.hlrs.de/projects/marmot/publications/paralleldebugging-ppt.pdf

为MPICH配置valgrind：使用了错误的libmpi * .so文件

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