Question

由于我正在使用的采样率以及它正在计算的数量，我一直试图平滑一个噪声很大的情节。我一直在使用这里的帮助 - 主要是Plot smooth line with PyPlot（虽然我找不到“样条”功能，所以使用UnivarinteSpline代替）

但是，无论我做什么，我都会遇到"x and y are not of the same length"或scipi.UnivariateSpline的{{1}}值不正确的pyplot错误。我不太确定如何解决这个问题（不是真正的Python人！）我已经附加了代码，尽管它只是最后的绘图位导致了问题。感谢

有关信息，数据输入文件只是一个整数列表（两个列表由选项卡分隔，如代码所示）。

以下是我收到的错误代码之一：

import os.path
import matplotlib.pyplot as plt
import scipy.interpolate as sci
import numpy as np
def main():
    jcc = "0050"
    dj = "005"
    l = "060"
    D = 20
    hT = 4 * D
    wT1 = 2 * D
    wT2 = 5 * D
    for jcm in ["025","030","035","040","045","050","055","060"]:
        characteristic = "LeadersOnly/Jcm" + jcm + "/Jcc" + jcc + "/dJ" + dj + "/lambda" + l + "/Seed000"
        fingertime1 = []
        fingertime2 = []
        stamp =[]
        finger=[]
        for x in range(0,2500,50):
            if x<10000:
                z=("00"+str(x))
            if x<1000:
                z=("000"+str(x))
            if x<100:
                z=("0000"+str(x))
            if x<10:
                z=("00000"+str(x))
            stamp.append(x)
            path = "LeadersOnly/Jcm" + jcm + "/Jcc" + jcc + "/dJ" + dj + "/lambda" + l + "/Seed000/profile_" + str(z) + ".txt"
            if os.path.exists(path):
                f = open(path, 'r')
                pr1,pr2=np.genfromtxt(path, delimiter='\t', unpack=True)
                p1=[]
                p2=[]
                h1=[]
                h2=[]
                a1=[]
                a2=[]
                finger1 = 0
                finger2 = 0
                for b in range(len(pr1)):
                    p1.append(pr1[b])
                    p2.append(pr2[b])
                for elem in range(len(pr1)-80):
                    h1.append((p1[elem + (2*D)]-0.5*(p1[elem]+p1[elem + (4*D)])))
                    h2.append((p2[elem + (2*D)]-0.5*(p2[elem]+p2[elem + (4*D)])))
                    if h1[elem] >= hT:
                        a1.append(1)
                    else:
                        a1.append(0)
                    if h2[elem]>=hT:        
                        a2.append(1)
                    else:
                        a2.append(0)
                for elem in range(len(a1)-1):
                    if (a1[elem] - a1[elem + 1]) != 0:
                        finger1 = finger1 + 1
                finger1 = finger1 / 2
                for elem in range(len(a2)-1):
                    if (a2[elem] - a2[elem + 1]) != 0:
                        finger2 = finger2 + 1
                finger2 = finger2 / 2
                fingertime1.append(finger1)
                fingertime2.append(finger2)
                finger.append((finger1+finger2)/2)
        namegraph = jcm
        stampnew = np.linspace(stamp[0],stamp[-1],300)
        fingernew = sci.UnivariateSpline(stamp, finger, stampnew)
        plt.plot(stampnew,fingernew,label=namegraph)
    plt.show()      

main()

Answer 1

让我们从for x in range(0, 2500, 50):

开始分析您的代码

您将z定义为以0填充的6位数字符串。您应该使用像z = "{0:06d}".format(x)或z = "%06d" % x这样的字符串格式，而不是您的这些多次测试。
在循环结束时，stamp将有(2500//50)=50个元素。
您检查文件是否存在path，然后打开并阅读，但您永远不会关闭它。更多的Pythonic方式是：
```
try:
    with open(path,"r") as f:
        do...
except IOError:
    do something else
```
使用with语法，您的文件会自动关闭。
pr1和pr2可能是一维数组，对吧？您可以真正简化p1和p2列表的构建：
```
p1 = pr1.tolist()
p2 = pr2.tolist()
```
您的列表a1，a2具有相同的大小：您可以将for elem in range(len(a..)-1)个圈组合在一个中。您也可以使用np.diff功能。
在for x in range(...)循环结束时，finger将有50个元素减去丢失文件的数量。由于您不知道在文件丢失的情况下该怎么做，因此stamp和finger列表可能没有相同数量的元素，这会导致scipy.UnivariateSpline崩溃。一个简单的解决方法是仅在stamp文件被定义时更新path列表（这样，它始终与finger具有相同数量的元素。）
< / LI>
当stampnew和stamp最多只有50个时，您的finger数组有300个元素。这是第二个问题，即权重数组的大小（{ {1}}）必须与输入的大小相同。
您最终会尝试绘制stampnew vs fingernew。问题是stamp 不一个数组，它是fingernew的实例。您仍然需要计算一些实际点数，例如使用UnivariateSpline，然后在fingernew(stamp)函数中使用它。

在Python中平滑图形的问题

1 个答案: