自动化R中的大圆图制作

Question

我已经在流动数据中学到了一些我学到的东西great circle mapping tutorial，并将它们与评论中链接的代码相结合，以防止在R描绘跨赤道大圆时发生奇怪的事情。这给了我这个：

airports <- read.csv("/home/geoff/Desktop/DissertationData/airports.csv", header=TRUE) 
flights <- read.csv("/home/geoff/Desktop/DissertationData/ATL.csv", header=TRUE, as.is=TRUE)

library(maps)
library(geosphere)

checkDateLine <- function(l){
  n<-0
  k<-length(l)
  k<-k-1
  for (j in 1:k){
    n[j] <- l[j+1] - l[j]
  }
  n <- abs(n)
  m<-max(n, rm.na=TRUE)
  ifelse(m > 30, TRUE, FALSE)
}
clean.Inter <- function(p1, p2, n, addStartEnd){
  inter <- gcIntermediate(p1, p2, n=n, addStartEnd=addStartEnd)
  if (checkDateLine(inter[,1])){
    m1 <- midPoint(p1, p2)
    m1[,1] <- (m1[,1]+180)%%360 - 180
    a1 <- antipode(m1)
    l1 <- gcIntermediate(p1, a1, n=n, addStartEnd=addStartEnd)
    l2 <- gcIntermediate(a1, p2, n=n, addStartEnd=addStartEnd)
    l3 <- rbind(l1, l2)
    l3
  }
  else{
    inter
  }
}

# Unique months
monthyear <- unique(flights$month)

# Color
pal <- colorRampPalette(c("#FFEA00", "#FF0043"))
colors <- pal(100)

for (i in 1:length(monthyear)) {

png(paste("monthyear", monthyear[i], ".png", sep=""), width=750, height=500)
map("world", col="#191919", fill=TRUE, bg="black", lwd=0.05)

fsub <- flights[flights$month == monthyear[i],]
fsub <- fsub[order(fsub$cnt),]
maxcnt <- max(fsub$cnt)
for (j in 1:length(fsub$month)) {
  air1 <- airports[airports$iata == fsub[j,]$airport1,]
  air2 <- airports[airports$iata == fsub[j,]$airport2,]
  p1 <- c(air1[1,]$long, air1[1,]$lat)
  p2 <- c(air2[1,]$long, air2[1,]$lat)
  inter <- clean.Inter(p1,p2,n=100, addStartEnd=TRUE)
  colindex <- round( (fsub[j,]$cnt / maxcnt) * length(colors) )
  lines(inter, col=colors[colindex], lwd=1.0)
}
  dev.off()
}

我想自动生成包含所有预定商业路线的大型数据集的地图 - dummy sample - 在ATL和全球网络中的其他机场之间共享（Airports.csv链接到流动数据）后）。我最好每个月制作一张地图，用作描述亚特兰大机场网络空间变化的简短视频中的框架。

问题：我不能让循环产生任何多个PNG - 从每个CSV中的第一个唯一月份 - 每次运行它。我相当肯定Aaron Hardin的代码“打破”自动化，因为它在Flowing Data教程中使用。经过三天的混乱和追逐任何相关的R操作方法后，我意识到我只是缺乏调整与另一个相关的印章。任何人都可以帮助我自动化这个过程吗？

有一篇论文的确认书给你了！

Answer 1

评论的信息太多，所以我发布了一个答案。这就是我的想法（并在最后阅读以了解可能存在的问题）：

我试图在Flowing Data教程中对原始数据运行代码。 （显然你必须为月度数据添加一列，所以我只是添加这一行来随机化月份：）：

airports <- read.csv("http://datasets.flowingdata.com/tuts/maparcs/airports.csv",
                     header=TRUE) 
flights <- read.csv("http://datasets.flowingdata.com/tuts/maparcs/flights.csv", 
                    header=TRUE, as.is=TRUE)

# Add column with random data for month
flights$month <- sample(month.abb[1:4], nrow(flights), replace=TRUE)

每当我有一个需要很长时间才能运行的循环时，我通常会在那里粘贴一些代码来给我一个进度检查。使用您喜欢的内容：print，cat，tcltk::tkProgressBar。我使用message：

for (i in 1:length(monthyear)) {
  message(i)
  #
  # your code here
  #
}

---

无论如何，我随后运行了你的代码。一切都完全正常。由于我采样了四个月的数据，我得到了：

• 当前i迭代的消息打印四次
• 四个png图，每个图都有一个黑色的世界地图和明亮的黄色线条。以下是四行之一：

---

那么，为什么它在我的机器上运行而不在你的机器上呢？

我只能猜测，但我的猜测是你没有设置工作目录。您的代码中没有setwd，对png的调用只提供了文件名。我怀疑你的代码是写在你系统中的工作目录中的。

默认情况下，在我的安装中，工作目录为：

getwd()
[1] "C:/Program Files/eclipse 3.7"

要解决此问题，请执行以下操作之一：

1. 使用setwd()将工作目录设置在脚本的顶部。
2. 或者在致电png()
时使用完整路径和文件名