Python - 迭代嵌套列表

时间:2011-07-27 12:12:19

标签: python list nested combinatorics bioinformatics

从昨天开始,我就陷入了一个小而棘手的问题。

我所拥有的是一个(可能是无限的)嵌套列表,如下所示:

[1,[2,[3,4]]] 
or [[1,2],[3,4]] and so on.

在每个级别上,列表由两个子列表组成(我没有使用元组,因为列表可能会在下一步中获得任意长度) 现在我想在此列表中的每个可能位置插入一个元素,并返回所有可能插入位置的列表列表。 因此,如果我插入5,我的输出应该如下:

[ [5,[1,[2,[3,4]]]],
[1,[5,[2,[3,4]]]],
[1,[2,[5,[3,4]]]],
[1,[2,[[3,5],4]]],
[1,[2,[3,[4,5]]]] ]

背景:我正在尝试通过一次添加一个分类单元来构建系统发育树。每个分类单元必须插入最适合的位置。

我现在得到的是:

def get_trees(nwklist,newid):
    if not isinstance(nwklist,list):
        return [newid,nwklist]
    else:
        return [newid,nwklist],[get_trees(nwklist[0],newid),nwklist[1]],[nwklist[0],get_trees(nwklist[1],newid)]

它不会产生我想要的输出,但有点接近。

([5, [1, [2, [3, 4]]]], 
[[5, 1], [2, [3, 4]]], 
[1, ([5, [2, [3, 4]]], [[5, 2], [3, 4]], [2, ([5, [3, 4]], [[5, 3], 4], [3, [5, 4]])])])

应该有一个简单的解决方案,可能涉及lambda函数,但我只是看不到它。

了Christoph

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

我会使用发电机:

def gen_trees(nwklist, newid):
  yield [newid] + [nwklist]
  if isinstance(nwklist, list):
    for i in xrange(len(nwklist)):
      for l in gen_trees(nwklist[i], newid):
        yield nwklist[:i] + [l] + nwklist[i+1:]
  yield [nwklist] + [newid]

for l in gen_trees([1,[2,[3,4]]] , 5):
  print l

请注意,这会返回比示例中列出的更多的树:

[5, [1, [2, [3, 4]]]]
[[5, 1], [2, [3, 4]]]
[[1, 5], [2, [3, 4]]]
[1, [5, [2, [3, 4]]]]
[1, [[5, 2], [3, 4]]]
[1, [[2, 5], [3, 4]]]
[1, [2, [5, [3, 4]]]]
[1, [2, [[5, 3], 4]]]
[1, [2, [[3, 5], 4]]]
[1, [2, [3, [5, 4]]]]
[1, [2, [3, [4, 5]]]]
[1, [2, [[3, 4], 5]]]
[1, [[2, [3, 4]], 5]]
[[1, [2, [3, 4]]], 5]

据我所知,这符合规定的要求。如果有一些我没有得到的未说明的要求(例如,如果每个子列表的第一个元素必须是标量),请澄清并且我将更新解决方案。