Question

我有以下方法使用qsub提交集群作业：

 Submitting jobs from standard input
       To submit a PBS job by typing job specifications at the command line, the user types

              qsub [options] <return>

       then types any directives, then any tasks, followed by

              (in UNIX)     CTRL-D on a line by itself
              (in Windows)  CTRL-Z <return>

       to terminate the input.

有没有办法可以在bash脚本中对RETURN和CTRL-D进行编码，以便我们可以执行以下操作：

for i in path/*.txt; do echo "$i";  qsub [RETURN] /path2/mycode $i; [CTRL-D]; done

Answer 1

您应该通过管道使用重定向：

for i in path/*.txt; do
  echo "$i";
  echo "/path2/mycode $i" | qsub;
done

Answer 2

尝试echo /path2/mycode $i | qsub。

如果这不起作用或您需要传递更复杂的数据，那么expect可能会有所帮助。

Answer 3

只是为了澄清（因为corvus的答案是完全正确的） - CTRL-D只是意味着“文件结束”或“输入结束”，所以当你将该文本回显给qsub时，它会自动发送一个结尾之后的文件信号（与按CTRL-D相同）

将键盘命令编码为Bash脚本

3 个答案: