numpy数组中子矩阵的矢量化提取

时间:2020-05-02 09:48:50

标签: python numpy image-processing computer-vision vectorization

我的目标是实现一个中值滤波器,它是一个功能,用周围像素的中值替换(主要是)二维阵列中的每个像素。可用于对图像进行降噪。

我的实现从原始矩阵中提取子矩阵,这些子矩阵包含像素本身及其邻居。目前,这种提取是通过for循环完成的,并且您可以想象到for循环占用了大约95%的执行时间。

这是我当前的实现方式:

def median_blur(img, fsize=3):
    img_intermediate = np.zeros((img.shape[0] + 2, img.shape[1] + 2), np.uint8)  # First intermediate img, used for padding original image
    img_intermediate[1:img.shape[0]+1, 1:img.shape[1]+1] = img
    img_result = np.empty((*img.shape, fsize, fsize), np.uint8)  # Will contain result, first receives kernel-submatrices

    # Extract submatrices from image
    for i in range(img.shape[0]):
        for j in range(img.shape[1]):
            img_result[i, j] = img_intermediate[i:i+fsize, j:j+fsize]

    img_result = img_result.reshape(*img.shape, fsize**2)  # Reshape Result-Matrix
    img_result = np.median(img_result, axis=2)  # Calculate median in one go
    return img_result.astype('uint8')

如何使用矢量化操作提取这些子矩阵?

作为奖励,如果有计算机视觉经验的人正在阅读以下内容:除了将其应用于中间零填充矩阵之外,是否有更好的方法来实现中值滤波器?

非常感谢您。

1 个答案:

答案 0 :(得分:3)

这是向量化的解决方案。但是,您可以通过注意图像阵列的内存顺序来提出更快的解决方案:

from numpy.lib.stride_tricks import as_strided

img_padded = np.pad(img, 1, mode='constant')
sub_shape = (fsize, fsize)
view_shape = tuple(np.subtract(img_padded.shape, sub_shape) + 1) + sub_shape
sub_img = as_strided(img_padded, view_shape, img_padded.strides * 2)
sub_img = sub_img.reshape(img.shape + (fsize**2,))
result = np.median(sub_img, axis=2).astype(int)

使用pad函数先填充,然后使用as_strided填充sub_matrices,最后将median应用于步幅。

更新:使用@Divakar在评论中建议的view_as_windows

from skimage.util.shape import view_as_windows

img_padded = np.pad(img, 1, mode='constant')
sub_shape = (fsize, fsize)
view_shape = view_as_windows(img_padded, sub_shape, 1)
sub_img = view_shape.reshape(img.shape + (fsize**2,))
result = np.median(sub_img, axis=2).astype(int)

view_as_windows还提供类似于跨步的子矩阵。

示例图像和输出:

img: 
[[ 1  2  3  4  5  6]
 [ 7  8  9 10 11 12]
 [13 14 15 16 17 18]
 [19 20 21 22 23 24]]

median_filtered: 
[[ 0  2  3  4  5  0]
 [ 2  8  9 10 11  6]
 [ 8 14 15 16 17 12]
 [ 0 14 15 16 17  0]]