Question

我当前正在使用Spyder for Python，打开程序时出现以下错误消息：错误：您缺少依赖项！

rtree> = 0.8.3：无（否）

请安装它们以避免出现此消息。

注意：Spyder可以在没有这些依赖项的情况下工作，但是我们强烈建议您获得平稳的体验。

我尝试通过pip安装rtree并得到：

Collecting rtree
  Downloading https://files.pythonhosted.org/packages/11/1d/42d6904a436076df813d1df632575529991005b33aa82f169f01750e39e4/Rtree-0.9.3.tar.gz (520kB)
     |████████████████████████████████| 522kB 467kB/s
    ERROR: Command errored out with exit status 1:
     command: 'C:\Users\gitte\Anaconda3\python.exe' -c 'import sys, setuptools, tokenize; sys.argv[0] = '"'"'C:\\Users\\gitte\\AppData\\Local\\Temp\\pip-install-kmbt5h2t\\rtree\\setup.py'"'"'; __file__='"'"'C:\\Users\\gitte\\AppData\\Local\\Temp\\pip-install-kmbt5h2t\\rtree\\setup.py'"'"';f=getattr(tokenize, '"'"'open'"'"', open)(__file__);code=f.read().replace('"'"'\r\n'"'"', '"'"'\n'"'"');f.close();exec(compile(code, __file__, '"'"'exec'"'"'))' egg_info --egg-base pip-egg-info
         cwd: C:\Users\gitte\AppData\Local\Temp\pip-install-kmbt5h2t\rtree\
    Complete output (11 lines):
    Traceback (most recent call last):
      File "<string>", line 1, in <module>
      File "C:\Users\gitte\AppData\Local\Temp\pip-install-kmbt5h2t\rtree\setup.py", line 3, in <module>
        import rtree
      File "C:\Users\gitte\AppData\Local\Temp\pip-install-kmbt5h2t\rtree\rtree\__init__.py", line 1, in <module>
        from .index import Rtree
      File "C:\Users\gitte\AppData\Local\Temp\pip-install-kmbt5h2t\rtree\rtree\index.py", line 6, in <module>
        from . import core
      File "C:\Users\gitte\AppData\Local\Temp\pip-install-kmbt5h2t\rtree\rtree\core.py", line 128, in <module>
        raise OSError("could not find or load %s" % lib_name)
    OSError: could not find or load spatialindex_c-64.dll
    ----------------------------------------
ERROR: Command errored out with exit status 1: python setup.py egg_info Check the logs for full command output.

请告知我该怎么做。到目前为止，Spyder的运行情况非常好，我只是不想在此过程中遇到任何问题。谢谢！

Answer 1

看起来Rtree需要libspatialindex（https://libspatialindex.org），该文件不会自动安装。似乎有些开发人员已经意识到了这个问题，并着手进行修复：

https://github.com/Toblerity/rtree/issues/146 https://github.com/Toblerity/rtree/issues/147

Answer 2

在这里遇到同样的问题，我不使用conda，也无法使用libspatialindex安装pipenv：

# macOS Mojave 10.14.5
# python 3.7.4 (via pyenv)

Error: Command "python setup.py egg_info" failed with error code 1 in /var/folders/r7/2sx1wsvx0gj5x43wkmymg61w0000gq/T/tmpn09357tzbuild/rtree/

找到了solution-通过Homebrew安装spatialindex：

brew install spatialindex

然后pipenv install rtree成功了，现在geopandas正常运行了
希望能帮上忙

Answer 3

我遇到了同样的问题，并尝试了此页面中显示的所有解决方案。但是失败了。

最后，我找到了解决方案......

在底部运行 anaconda-navigator。
点击并激活您要修复的环境
在右侧的搜索栏中，输入“rtree”，您可以看到已安装的“rtree”，其版本可能为 0.9.3。
单击“名称”选项卡中“rtree”左侧的绿色小复选框，然后将鼠标光标放在“特定安装的掩码”菜单上。
点击版本“0.8.3”以通过 anaconda-navigator 降级。

之后，我执行了spyder，错误信息消失了。

Answer 4

我也遇到了同样的问题。就我而言（Ubuntu2004 和 Python 3.8），当我尝试使用 spyder 4.2.1 安装 conda install spyder 时，rtree 的问题仍然存在。

然而，当我用 conda list rtree 检查它的安装时。它已显示成功安装 version 0.9.7。尽管如此，我还尝试使用 rtree 或 pip 安装 conda 软件包。没有一个成功。

之后，我尝试了不同的安装命令（基本上，使用不同的 conda 通道），然后，这个问题就消失了。请注意，下面它使用 conda-forge 频道下载 spyder。

conda create --name spy42py38 python==3.8
conda install spyder=4.2.1 -c conda-forge

Answer 5

我在使用 conda --update all 更新 linux mint anaconda 后收到此消息。当安装丢失包的建议方法给出一条消息时，所有必需的依赖项都已安装。

我使用 conda list --revisions 列出修订，然后使用 conda install --revision N，其中 N 是最后一个修订的下一个，在我的例子中是修订 10。这解决了问题。修订版 11 是罪魁祸首。

我注意到它包含一个新的 spyder 内核。

Answer 6

如果您使用的是 Anaconda，请执行以下命令：

session_start();

// Included for clarity - this would typically be in a config
define('CSRFTOKEN', '__csrftoken');

$root_domain = $_SERVER['HTTP_HOST'] ?? false;
$referrer = parse_url($_SERVER['HTTP_REFERER'] ?? '', PHP_URL_HOST);

// Check submission was from same origin
if ($root_domain !== $referrer) {
    // Invalid attempt
    die();
}

// Extract and validate token
$token = $_POST[CSRFTOKEN] ?? false;
$sessionToken = $_SESSION[CSRFTOKEN] ?? false;
if (!empty($token) && $token === $sessionToken) {
  // Request is valid so process it
}

// Invalidate the token  
$_SESSION[CSRFTOKEN] = false;
unset($_SESSION[CSRFTOKEN]);

虽然我有 0.9.7 版的 rtree，但 Spyder 无法检测到它。所以我不得不手动降级它。

缺少rtree的依赖关系

6 个答案: