我想获得以下函数的黑森州:
def llik_scalars(param_vector, *args):
Fsc = param_vector[0]
Qsc = param_vector[1]
Rsc = param_vector[2]
y = args[0]
burnin = args[1]
F = np.matrix(Fsc)
Q = np.matrix(Qsc)
R = np.matrix(Rsc)
predstate, predp, _, _ = kalmanfilter(F=F, Q=Q, R=R, y=y, plot = False)
T = len(predp)
predstate = np.array([predstate[t].item() for t in range(len(predstate))])
predp = np.array([predp[t].item() for t in range(len(predp))])
Sigmat = predp + Rsc
Mut = predstate
LL = 0
for t in range(burnin, T):
exponent = -0.5 * (y[t]-Mut[t])**2 / Sigmat[t]
cc = 1 / math.sqrt(2*math.pi*Sigmat[t])
LL -= math.log(cc*math.exp(exponent))
return LL
我正在尝试使用numdifftools软件包的Hessian函数来完成此操作。 在文档中,我找到了以下信息。例如,如果您想要定义为Rosen的rosenbrock函数的粗麻布,则粗麻布的计算方法如下:
> H = nd.Hessian(rosen)([1, 1])
在点[1,1]中计算黑森州的位置
根据文档,应该可以为Hessian函数提供参数:
class Hessian(f, step=None, method=’central’, order=2, full_output=False, **step_options)
Parameters
fun [function] function of one array fun(x, *args, **kwds)
我通过以下方式尝试了这一点:
hess = nd.Hessian(kf.llik_scalars(themin.x, (y,burnin)))(themin.x)
themin.x是我要评估Hessian的点。
themin.x
Out[49]: array([0.67605231, 0.7457089 , 0.72205726])
运行上面的代码时出现的错误:
burnin = args[1]
IndexError: tuple index out of range
我不明白元组如何超出范围
答案 0 :(得分:0)
在没有完整功能和参数的情况下调试电话有点困难,这就是为什么我只是使用rosen
函数制作了一个简单示例。
我添加了两个伪造的附加参数,并将新函数命名为rosen_ext
。
将numdifftools导入为nd 将numpy导入为np
def rosen(x):
return (1-x[0])**2 + 105.*(x[1]-x[0]**2)**2
def rosen_ext(x, *args):
y = args[0]
burnin = args[1]
print(y)
print(burnin)
return (1-x[0])**2 + 105.*(x[1]-x[0]**2)**2
以您的方式调用Hessian
的{{1}}时,我可以重现您的错误。
x = [2,2]中rosen_ext
的{{1}}应该是
Hessian
要获得rosen
的结果,您需要这样称呼:
[[4202. -840.]
[-840. 210.]]
它返回一堆2和3(有助于查看是否正确放置了其他参数)和正确答案。
rosen_ext
使用这种方法,我想您的电话应该是这样的:
# call of the Hessian for the modified rosen in some point X = [2, 2]
H = nd.Hessian(rosen_ext)([2, 2], 2, 3)
print(H)
我无法调试它,所以请您检查一下是否可以运行?